RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	C10orf111	Q8N326	155 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	ASB5	Q8WWX0	329 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	ROPN1L	Q96C74	230 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF145	Q96MT1	663 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM234B	A2RU67	622 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADAM11	O75078	769 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	TGDS	O95455	350 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	H6PD	O95479	791 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	AK1	P00568	194 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	OPN1LW	P04000	364 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL6	P05231	212 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	HPGD	P15428	266 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF17	P17021	662 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	BMP5	P22003	454 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	GCK	P35557	465 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	TIMP3	P35625	211 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHRNE	Q04844	493 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	SKP2	Q13309	424 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF141	Q15928	474 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	FIG4	Q92562	907 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTF2H4	Q92759	462 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZG16B	Q96DA0	208 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADGRG7	Q96K78	797 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR45	Q9Y484	360 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	SERINC4	A6NH21	518 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	DUXA	A6NLW8	204 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	EFNA2	O43921	213 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	STX11	O75558	287 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUDT7	P0C024	238 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBL4A	P11441	157 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	PEPD	P12955	493 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ETFA	P13804	333 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	P2RX1	P51575	399 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCR4	P51679	360 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	DLX5	P56178	289 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	STX1B	P61266	288 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	GUCY1A3	Q02108	690 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGFBP1	Q14512	234 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPAT3	Q53EU6	434 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	MISP	Q8IVT2	679 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF527	Q8NB42	609 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	PINK1	Q9BXM7	581 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	EXD2	Q9NVH0	621 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	MPDZ	O75970	2070 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAST4	O15021	2626 aa		10	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A0G2JND7	137 aa		10	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	C7orf72	A4D263	438 aa		10	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSPB2	A8KAH6	182 aa		10	□□□□□ -0.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81

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