RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CLDN24	A6NM45	220 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF264	O43296	627 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	HPR	P00739	348 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CELA2A	P08217	269 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	NPIPA8	P0DM63	369 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	PEX2	P28328	305 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	MSX1	P28360	303 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RRM2	P31350	389 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	EVI2B	P34910	448 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC6A8	P48029	635 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RFX3	P48380	749 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SSR4	P51571	173 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SKP2	Q13309	424 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	MEP1A	Q16819	746 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	LPCAT4	Q643R3	524 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ARSG	Q96EG1	525 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF597	Q96LX8	424 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	MCHR1	Q99705	422 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC29A1	Q99808	456 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	LHPP	Q9H008	270 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	VCX	Q9H320	206 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CNIH4	Q9P003	139 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	LHX6	Q9UPM6	363 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529		J3KTA2	159 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529		M0R3H8	397 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	TNFRSF11B	O00300	401 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ZZEF1	O43149	2961 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	NDUFB5	O43674	189 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP7B1	O75881	506 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	DIRAS1	O95057	198 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	GADD45G	O95257	159 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ALPL	P05186	524 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	UBL4A	P11441	157 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ANXA8	P13928	327 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ALDH3A2	P51648	485 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SESN3	P58005	492 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP2R2B	Q00005	443 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	EPS8	Q12929	822 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CD226	Q15762	336 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	MICA	Q29983	383 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	FAHD1	Q6P587	224 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	DEF8	Q6ZN54	512 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	PRR22	Q8IZ63	422 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	GRHL3	Q8TE85	626 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	MPP4	Q96JB8	637 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	NODAL	Q96S42	347 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CIB1	Q99828	191 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	C12orf10	Q9HB07	376 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	VNN3	Q9NY84	501 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A087WV48	116 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0B4J2E0	115 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1B0GX12	115 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TRAF4-208	ENST00000469529	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54

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