RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 ST3GAL3Q11203 375 aa8.55□□□□□ -1.04
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DDX39B-215ENST00000462256 CASP12Q6UXS9 341 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 TMPPEQ6ZT21 453 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 SH2D5Q6ZV89 423 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 MARCH3Q86UD3 253 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 SLC16A11Q8NCK7 471 aa8.55□□□□□ -1.04
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DDX39B-215ENST00000462256 TP53INP1Q96A56 240 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 EME1Q96AY2 570 aa8.55□□□□□ -1.04
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DDX39B-215ENST00000462256 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 ASB4Q9Y574 426 aa8.55□□□□□ -1.04
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DDX39B-215ENST00000462256 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.55□□□□□ -1.04
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DDX39B-215ENST00000462256 RAD23AP54725 363 aa8.55□□□□□ -1.04
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DDX39B-215ENST00000462256 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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DDX39B-215ENST00000462256 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.55□□□□□ -1.04
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DDX39B-215ENST00000462256 C3orf30Q96M34 536 aa8.54□□□□□ -1.04
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DDX39B-215ENST00000462256 A0A087WV62 115 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 FITM1A5D6W6 292 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 FRG2CA6NGY1 282 aa8.54□□□□□ -1.04
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DDX39B-215ENST00000462256 GPR171O14626 319 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 GSC2O15499 205 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 RNF13O43567 381 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 ASNA1O43681 348 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 SNNO75324 88 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 CNR1P21554 472 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 CHRNEQ04844 493 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 CARTPTQ16568 116 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 KIF18BQ86Y91 864 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 P3H2Q8IVL5 708 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 ASB5Q8WWX0 329 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 PINK1Q9BXM7 581 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF700Q9H0M5 742 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 ASB6Q9NWX5 421 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 SERINC4A6NH21 518 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 ANPEPP15144 967 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 GAB1Q13480 694 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 ADRM1Q16186 407 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 HBMQ6B0K9 141 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 OR7G2Q8NG99 324 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 TEX47Q8TBZ9 253 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 MED18Q9BUE0 208 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 U3KQA8 63 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.53□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.53□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1B0GUH1 482 aa8.53□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
DDX39B-215ENST00000462256 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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