RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 SFTPDP35247 375 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 CARD18P57730 90 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 BEX5Q5H9J7 111 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 MISPQ8IVT2 679 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDT8Q8WV74 236 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 OSTF1Q92882 214 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 MTERF3Q96E29 417 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ARSGQ96EG1 525 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 APOPT1Q96IL0 206 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 MECRQ9BV79 373 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 C12orf49Q9H741 205 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1W2PQD3 144 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM114B3SHH9 223 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 NPHS1O60500 1241 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 SPAG7O75391 227 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 NTN1O95631 604 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 HSPA4LO95757 839 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDT14O95848 222 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PLAUP00749 431 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 HEXAP06865 529 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 FGF4P08620 206 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 DDX5P17844 614 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP6V1C1P21283 382 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 MAPK1P28482 360 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 AGTR1P30556 359 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ALDH3A1P30838 453 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF117Q03924 483 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXF1Q12946 379 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 TP53BP2Q13625 1128 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PTGR1Q14914 329 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PDSS1Q5T2R2 415 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 STK32CQ86UX6 486 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 TRABD2AQ86V40 505 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 LILRA2Q8N149 483 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 BANPQ8N9N5 519 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXO27Q8NI29 283 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ABHD3Q8WU67 409 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHL15Q96M94 604 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 STACQ99469 402 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 C1orf50Q9BV19 199 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ACTR6Q9GZN1 396 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PIGUQ9H490 435 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 DUSP22Q9NRW4 184 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 GLRX2Q9NS18 164 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC17A7Q9P2U7 560 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 CADP27708 2225 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 COL6A5A8TX70 2615 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM171A2A8MVW0 826 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF195O14628 629 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 EFNA2O43921 213 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 C6orf47O95873 294 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 TUBBP07437 444 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ARRB2P32121 409 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 PTH2RP49190 550 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF844Q08AG5 666 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 MLC1Q15049 377 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 TSC22D1Q15714 1073 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 XKR7Q5GH72 579 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM201Q5SNT2 666 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-206ENST00000446904 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms