RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 HMGCLP35914 325 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RAP2BP61225 183 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TLE4Q04727 773 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FGL2Q14314 439 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 KIR2DS3Q14952 304 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 LAPTM4AQ15012 233 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR4K13Q8NH42 304 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MUCL1Q96DR8 90 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 H7C1Q1 480 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 DIO3P55073 304 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 NAA40Q86UY6 237 aa6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MFFQ9GZY8 342 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 HHLA2Q9UM44 414 aa6.31□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.3□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 PROS1P07225 676 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CNR2P34972 360 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 BMXP51813 675 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 C14orf80Q86SX3 495 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ELP4Q96EB1 424 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MAP3K3Q99759 626 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SMOQ99835 787 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.3□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 SRYQ05066 204 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CMPK2Q5EBM0 449 aa6.3□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.3□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.3□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 TMEM19Q96HH6 336 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 F2RL3Q96RI0 385 aa6.3□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 CRB3Q9BUF7 120 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 KCNK12Q9HB15 430 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 V9GY05 133 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 F5H5K5 113 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SPDEFO95238 335 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PTGER4P35408 488 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 RABGGTBP53611 331 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ATP1B3P54709 279 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 NUDT9Q9BW91 350 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 OR51J1Q9H342 316 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.3□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.3□□□□□ -1.4
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