RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 Q5PR19 223 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf136Q5SQH8 315 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 BEND4Q6ZU67 534 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 C22orf34Q6ZV56 151 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 SFXN5Q8TD22 340 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 TCP10LQ8TDR4 215 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 COQ8BQ96D53 544 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL15Q96M94 604 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 HS3ST6Q96QI5 342 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL4Q9C0H6 718 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 GPATCH2Q9NW75 528 aa18.77■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 PRPS1L1P21108 318 aa18.76■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V1C1P21283 382 aa18.76■□□□□ 0.59
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LIMS1-208ENST00000428064 STAC2Q6ZMT1 411 aa18.76■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 STK32CQ86UX6 486 aa18.76■□□□□ 0.59
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LIMS1-208ENST00000428064 LILRA2Q8N149 483 aa18.76■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 RNF128Q8TEB7 428 aa18.76■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 C3orf30Q96M34 536 aa18.76■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
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LIMS1-208ENST00000428064 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 CXorf36Q9H7Y0 433 aa18.76■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 UBTD1Q9HAC8 227 aa18.76■□□□□ 0.59
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LIMS1-208ENST00000428064 SNX8Q9Y5X2 465 aa18.76■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 FAM171A2A8MVW0 826 aa18.75■□□□□ 0.59
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LIMS1-208ENST00000428064 ADAMTS15Q8TE58 950 aa18.75■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM185BQ9H7F4 350 aa18.75■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 GP6Q9HCN6 339 aa18.75■□□□□ 0.59
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LIMS1-208ENST00000428064 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 GPR52Q9Y2T5 361 aa18.75■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
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LIMS1-208ENST00000428064 H3BNH8 94 aa18.74■□□□□ 0.59
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LIMS1-208ENST00000428064 SPAG7O75391 227 aa18.74■□□□□ 0.59
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LIMS1-208ENST00000428064 CARD18P57730 90 aa18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 IFFO1Q0D2I5 559 aa18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 TP53BP2Q13625 1128 aa18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 IL23RQ5VWK5 629 aa18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 BHLHB9Q6PI77 547 aa18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 IGFBPL1Q8WX77 278 aa18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 OSTF1Q92882 214 aa18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 CHMP6Q96FZ7 201 aa18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 COX4I2Q96KJ9 171 aa18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ZIM3Q96PE6 472 aa18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf50Q9BV19 199 aa18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 TIGARQ9NQ88 270 aa18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ASIC5Q9NY37 505 aa18.74■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf47O95873 294 aa18.73■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 OPN1LWP04000 364 aa18.73■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 BPGMP07738 259 aa18.73■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 PAX1P15863 534 aa18.73■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ETV4P43268 484 aa18.73■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ATP12AP54707 1039 aa18.73■□□□□ 0.59
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