RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422704.6

SEMA4D-208, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,382 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-208ENST00000422704 MEMO1Q9Y316 297 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 DISC1C4P0D8 188 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 KCNK5O95279 499 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 C5AR1P21730 350 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 HRH2P25021 359 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 HLA-DMAP28067 261 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 PBX2P40425 430 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 XCR1P46094 333 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 SLC26A5P58743 744 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 PCGF3Q3KNV8 242 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 PNCKQ6P2M8 343 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ASB15Q8WXK1 588 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 SNAPC3Q92966 411 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 HS6ST2Q96MM7 605 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ZNF559Q9BR84 538 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 APOOQ9BUR5 198 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 SLC2A11Q9BYW1 496 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 IKZF5Q9H5V7 419 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa9.96□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 K7ESM1 405 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ADAMTS4O75173 837 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 SLC2A5P22732 501 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 EPHA2P29317 976 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ART1P52961 327 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ZNF616Q08AN1 781 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 P2RY14Q15391 338 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 CMPK2Q5EBM0 449 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 SLC35D2Q76EJ3 337 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 SSX6Q7RTT6 188 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 TMEM151BQ8IW70 566 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 METTL4Q8N3J2 472 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 FRMD1Q8N878 549 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 OR5W2Q8NH69 310 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 TESCQ96BS2 214 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 PGAM5Q96HS1 289 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 WDR81Q562E7 1941 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 A0A0A6YYH2 397 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 A6NJ64 397 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 RP2O75695 350 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 NDUFB2O95178 105 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 MPIG6BO95866 241 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 UCHL1P09936 223 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 TUBG1P23258 451 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 MSX1P28360 303 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 GPR143P51810 404 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 TUBB3Q13509 450 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 GRM7Q14831 915 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 GPR19Q15760 415 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 KCNJ8Q15842 424 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 RHOXF1Q8NHV9 184 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 HHIPQ96QV1 700 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 RHNO1Q9BSD3 238 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 SLC5A7Q9GZV3 580 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 OR51B6Q9H340 312 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 IL23AQ9NPF7 189 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 TAPBPO15533 448 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 SLC19A2O60779 497 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 FARS2O95363 451 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 PITPNBP48739 271 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 RIDAP52758 137 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 HERV-K104P61576 105 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 ARSKQ6UWY0 536 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 PDZD3Q86UT5 571 aa9.95□□□□□ -0.82
SEMA4D-208ENST00000422704 CD163Q86VB7 1156 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms