RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACVR1BP36896 505 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRIM2P49643 509 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARD18P57730 90 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXF1Q12946 379 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD226Q15762 336 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP5Q16690 384 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFRP5Q5T4F7 317 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUSC5Q8IXB3 177 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LILRA2Q8N149 483 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF619Q8N2I2 560 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BANPQ8N9N5 519 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC16A11Q8NCK7 471 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KBTBD8Q8NFY9 601 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACMSDQ8TDX5 336 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEUROG1Q92886 237 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC126Q96EE4 140 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRXN1Q9BYN0 137 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POTEKPQ9BYX7 375 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBQLN4Q9NRR5 601 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NTMQ9P121 344 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIPT1Q9Y234 373 aa11.71□□□□□ -0.53
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.71□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NTN1O95631 604 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV4-39P01824 125 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THBS1P07996 1170 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRPH2P23942 346 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF1P41567 113 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAA20P61599 178 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA0040Q15053 153 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF385BQ569K4 471 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNJQ5T5M9 372 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PODNL1Q6PEZ8 512 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNM1P46Q6ZS02 220 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRMD7Q6ZUT3 714 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX18Q8N8Q8 333 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSD17B8Q92506 261 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GP6Q9HCN6 339 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIGARQ9NQ88 270 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMCNQ9ULC0 261 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL27Q9Y4X3 112 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPB8E9PQR5 432 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 G3V2L1 256 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBX19O60806 448 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC22BO75396 215 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNA2P01563 188 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALOX5P09917 674 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYL2P10916 166 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRKP42685 505 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINB4P48594 390 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MANFP55145 182 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF117Q03924 483 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BSPH1Q075Z2 132 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAPQ12884 760 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGGHGQ32M88 737 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZYG11AQ6WRX3 759 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCRLAQ7L513 359 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TDRPQ86YL5 185 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHC2Q8IXK0 858 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JADE3Q92613 823 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPCDCQ96CD2 204 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCT7Q99832 543 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM2Q9C040 744 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REEP4Q9H6H4 257 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COQ10BQ9H8M1 238 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YAE1D1Q9NRH1 226 aa11.7□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANK2Q01484 3957 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GJE1A6NN92 205 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM11O75078 769 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFS7O75251 213 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKD3O94806 890 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPA4LO95757 839 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAP00813 363 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UROSP10746 265 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDC1P18827 310 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGADQ13349 1161 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDE7AQ13946 482 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P2RY6Q15077 328 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms