RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM27D1Q5T7N8 215 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MTSS1LQ765P7 747 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 NRROSQ86YC3 692 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 HCAR1Q9BXC0 346 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52D1Q9H346 318 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D3EA0A087X179 549 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D3LB9A6J9 549 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SGK494L7N484 410 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 LANCL1O43813 399 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D3HP0C7X1 549 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PRG2P13727 222 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CFL1P23528 166 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 HTR2BP41595 481 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 RIN1Q13671 783 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD12Q6NUT3 480 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 BABAM2Q9NXR7 383 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PQU0 124 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 NOTOA8MTQ0 251 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVH48-1M5A8F1 160 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFB5O43674 189 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PLOD3O60568 738 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC43A1O75387 559 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 REM1O75628 298 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PAHP00439 452 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TBXA2RP21731 343 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SHC1P29353 583 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GPLD1P80108 840 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 BTBD16Q32M84 506 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TIGD3Q6B0B8 471 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SMRP1Q8NCR6 262 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM63Q969Q1 353 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ARSGQ96EG1 525 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GON7Q9BXV9 100 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF9O43307 516 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 C1QBP02746 253 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GKN3PP0CG01 181 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GAAP10253 952 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 EVI2BP34910 448 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC16A1P53985 500 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CEBPEQ15744 281 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ARL9Q6T311 187 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10H4Q8NGA5 316 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PFN4Q8NHR9 129 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 DEDD2Q8WXF8 326 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNN2Q9H2S1 579 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PQF6 199 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 DUXAA6NLW8 204 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 J3QRE1 110 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CEACAM5P06731 702 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CMPK1P30085 196 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GNG2P59768 71 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP5Q16690 384 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC58Q4VC31 144 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 NIPAL3Q6P499 406 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 LYPD8Q6UX82 237 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD9Q8NBP5 474 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 FANK1Q8TC84 345 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MS4A4EQ96PG1 132 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TIMP4Q99727 224 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPV5Q9NQA5 729 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 DAPL1A0PJW8 107 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 UNC119BA6NIH7 251 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 FXYD6P3P58550 94 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS7P62081 194 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR176Q14439 515 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 RD3Q7Z3Z2 195 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 LIX1LQ8IVB5 337 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SAMD12Q8N8I0 201 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC37A3Q8NCC5 494 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4E2Q8NGC2 313 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4M1Q8NGD0 313 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TIMM29Q9BSF4 260 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 C20orf141Q9NUB4 165 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR89AB7ZAQ6 455 aa17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms