RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 LINC00862A6NCI5 91 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANKRD61A6NGH8 418 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 A8MU76 341 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ALG1L2C9J202 215 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 M0QYG6 137 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SYT5O00445 386 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCDH17O14917 1159 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 BET1O15155 118 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CASC3O15234 703 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SEPT4O43236 478 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 LYRM1O43325 122 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SH3BP5O60239 455 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 TBL1XO60907 577 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 NBNO60934 754 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ATG13O75143 517 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ENTPD6O75354 484 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 NXPH3O95157 252 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CLDN7O95471 211 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 VNN2O95498 520 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 OLFM2O95897 454 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 KLKB1P03952 638 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 H1F0P07305 194 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 HBQ1P09105 142 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ALPIP09923 528 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ACP2P11117 423 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ITGB6P18564 788 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPP2R1BP30154 601 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCR7P32248 378 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 IFNA8P32881 189 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 TALDO1P37837 337 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR3A3P47888 321 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPINT3P49223 89 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 INPP1P49441 399 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SMSP52788 366 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARFIP1P53367 373 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ACLYP53396 1101 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAG2P55895 527 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 DSTNP60981 165 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 HBA1P69905 142 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CYP4F2P78329 520 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SHC2P98077 582 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 HSPA14Q0VDF9 509 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CNTN1Q12860 1018 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 TCF15Q12870 199 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 BAMBIQ13145 260 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLAMF1Q13291 335 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLD1Q13393 1074 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 DOC2AQ14183 400 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 MLC1Q15049 377 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRAM1Q15629 374 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CARTPTQ16568 116 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 BAK1Q16611 211 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 COL28A1Q2UY09 1125 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 MINDY4Q4G0A6 757 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCDC58Q4VC31 144 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SYTL3Q4VX76 610 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 KLHL12Q53G59 568 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CEP78Q5JTW2 689 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 DCST1Q5T197 706 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF626Q68DY1 528 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 FUT10Q6P4F1 479 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 BHLHB9Q6PI77 547 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 AGTRAPQ6RW13 159 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CRTC1Q6UUV9 634 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CXCL17Q6UXB2 119 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM108Q6UXF1 575 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC36A4Q6YBV0 504 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 COMMD6Q7Z4G1 85 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF280BQ86YH2 543 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CLECL1Q8IZS7 167 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC34A3Q8N130 599 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 KRT78Q8N1N4 520 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 GHDCQ8N2G8 530 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 Q8N402 240 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRAM1L1Q8N609 369 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 YIPF7Q8N8F6 280 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPERTQ8NA61 448 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 GPR26Q8NDV2 337 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR7G3Q8NG95 312 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR9Q2Q8NGE9 314 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms