RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF524Q96C55 264 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ROPN1LQ96C74 230 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 RMND5AQ9H871 391 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CHST11Q9NPF2 352 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SLC52A3Q9NQ40 469 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC167Q9P0B6 97 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa13.48□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CELSR2Q9HCU4 2923 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SERINC4A6NH21 518 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 NR5A2O00482 541 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SEC14L5O43304 696 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 H6PDO95479 791 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 AGR2O95994 175 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CHRM4P08173 479 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZCCHC18P0CG32 403 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 PEPDP12955 493 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 TIMP3P35625 211 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ATP4BP51164 291 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 P2RX1P51575 399 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CLDN20P56880 219 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 FOXF1Q12946 379 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SQLEQ14534 574 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 BCL2A1Q16548 175 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 GPAT3Q53EU6 434 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 C6orf10Q5SRN2 563 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CGB2Q6NT52 195 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 POMZP3Q6PJE2 187 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZG16BQ96DA0 208 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ITCHQ96J02 903 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 RNF145Q96MT1 663 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SAP130Q9H0E3 1048 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF385DQ9H6B1 395 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 RUBCNLQ9H714 662 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CALHM2Q9HA72 323 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ICAM5Q9UMF0 924 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 L3MBTL1Q9Y468 752 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 WDR45Q9Y484 360 aa13.47□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 A0A087WZY1 265 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 A0A0G2JND7 137 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 HSPB2A8KAH6 182 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 H3BNH8 94 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ANP32DO95626 131 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 KRT75O95678 551 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 LINGO3P0C6S8 592 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 UBL4AP11441 157 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ETFAP13804 333 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF17P17021 662 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 IL11P20809 199 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 GUCY1A3Q02108 690 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 PLAURQ03405 335 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 CHRNEQ04844 493 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 8.2
CSAG1-202ENST00000370287 MAPK11Q15759 364 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 HSPB2Q16082 182 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 AGKQ53H12 422 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 PAGE3Q5JUK9 113 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 GGNQ86UU5 652 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MSRB3Q8IXL7 192 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF619Q8N2I2 560 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 MARVELD3Q96A59 401 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZBTB8AQ96BR9 441 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SPDL1Q96EA4 605 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 UCN2Q96RP3 112 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SLC38A1Q9H2H9 487 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 TPT1P8Q9HAU6 139 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 HHATLQ9HCP6 504 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 KCNJ16Q9NPI9 418 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 POLE3Q9NRF9 147 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 SLAMF8Q9P0V8 285 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa13.46□□□□□ -0.25
CSAG1-202ENST00000370287 DOCK7Q96N67 2140 aa13.46□□□□□ -0.26
CSAG1-202ENST00000370287 CENPEQ02224 2701 aa13.46□□□□□ -0.26
CSAG1-202ENST00000370287 C7orf72A4D263 438 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG1-202ENST00000370287 CLDN24A6NM45 220 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG1-202ENST00000370287 LINC01387J3KSC0 135 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF264O43296 627 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG1-202ENST00000370287 NUDT14O95848 222 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG1-202ENST00000370287 TGM6O95932 706 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG1-202ENST00000370287 IL2RAP01589 272 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG1-202ENST00000370287 OPN1LWP04000 364 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG1-202ENST00000370287 GUSBP08236 651 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG1-202ENST00000370287 PRF1P14222 555 aa13.45□□□□□ -0.26
CSAG1-202ENST00000370287 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms