RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 DCDC2BA2VCK2 349 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 DRD5P21918 477 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 HIDE1A8MVS5 230 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO45P0C2W1 286 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK-25P63136 954 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 KCNJ10P78508 379 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 MELKQ14680 651 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF160Q9HCG1 818 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP57Q9NU63 452 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CBLCQ9ULV8 474 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 KLKB1P03952 638 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 IFNGR1P15260 489 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CD34P28906 385 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 PTGER1P34995 402 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 OPRL1P41146 370 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 GIPRP48546 466 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 TAP2Q03519 686 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CNIH2Q6PI25 160 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 OR8J2Q8NGG1 315 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 MYLIPQ8WY64 445 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 IRF2P14316 349 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 IMPA1P29218 277 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 AKR1C2P52895 323 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF7P61962 342 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ATG12O94817 140 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CCNJQ5T5M9 372 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CHPT1Q8WUD6 406 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 OR51E2Q9H255 320 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 NELFAQ9H3P2 528 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 TAAR2Q9P1P5 351 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 LRIT1Q9P2V4 623 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 MPIG6BO95866 241 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM244Q5VVB8 128 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A19Q695T7 634 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 GPR139Q6DWJ6 353 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RADILQ96JH8 1075 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SYNPO2LQ9H987 977 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A5Q9Y345 797 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 NAP1L6A6NFF2 107 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 EFCAB7A8K855 629 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SLC2A5P22732 501 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MAOBP27338 520 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PGGHGQ32M88 737 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ACSM3Q53FZ2 586 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 GAREM2Q75VX8 874 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RNF175Q8N4F7 328 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 FAM174AQ8TBP5 190 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 C20orf27Q9GZN8 174 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SLAMF8Q9P0V8 285 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MYH7BA7E2Y1 1941 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TACR1P25103 407 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ENTPD8Q5MY95 495 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MYADMQ96S97 322 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CDC6Q99741 560 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 APMAPQ9HDC9 416 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 INPP5EQ9NRR6 644 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CAPNS1P04632 268 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 WBP2NLQ6ICG8 309 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PXKQ7Z7A4 578 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A12Q96S37 553 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF337Q9Y3M9 751 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 F5H5K5 113 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 H0YGG7 62 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 HTR3BO95264 441 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CYCSP99999 105 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PCGF3Q3KNV8 242 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC28AQ8IWP9 274 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 L3MBTL4Q8NA19 623 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RCBTB1Q8NDN9 531 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 OR9A4Q8NGU2 314 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 B4GAT1O43505 415 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 OR7A5Q15622 319 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TLDC1Q6P9B6 456 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM150AQ86TG1 271 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RETREG3Q86VR2 466 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CHRDQ9H2X0 955 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MARCH5Q9NX47 278 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PLEK2Q9NYT0 353 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 A6NHS1 94 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZFAND5O76080 213 aa19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms