RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363091.1

SNORD1B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 1B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD1B, Length 84 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD1B-201ENST00000363091 CASTOR2A6NHX0 329 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 KNCNA6PVL3 124 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 LGALS16A8MUM7 142 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 C17orf105B2RV13 164 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 F5H6K3 240 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 G3V3Q6 166 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 MFNGO00587 321 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 CCSO14618 274 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 SLC7A4O43246 635 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 PRAMEF11O60813 436 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 RPS6KA5O75582 802 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 CABYRO75952 493 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 NPPAP01160 153 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 CALCAP01258 141 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 TK1P04183 234 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 SLC35G6P0C7Q6 338 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 VCLP18206 1134 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 BDNFP23560 247 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 KDELR1P24390 212 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 CST5P28325 142 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 SLC26A3P40879 764 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 EPS15P42566 896 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 SLC1A3P43003 542 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 MAP2K4P45985 399 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 GALR1P47211 349 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 FHITP49789 147 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 STK19P49842 368 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 ARFIP1P53367 373 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 RPL27P61353 136 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 HMGCS1Q01581 520 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 SLC34A1Q06495 639 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 KLRC3Q07444 240 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 ABRQ12979 859 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 ANKRD1Q15327 319 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 CEBPEQ15744 281 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 PCGF3Q3KNV8 242 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 IGSF11Q5DX21 431 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 TTC27Q6P3X3 843 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 GGT6Q6P531 493 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 ZNF767PQ75MW2 155 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 SCXQ7RTU7 201 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 CSNK1A1LQ8N752 337 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 OR2A12Q8NGT7 310 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 LILRB4Q8NHJ6 448 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 COQ8AQ8NI60 647 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 RNF133Q8WVZ7 376 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 C19orf43Q9BQ61 176 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 C20orf144Q9BQM9 153 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 MAGT1Q9H0U3 335 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 MMP27Q9H306 513 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 ACTL8Q9H568 366 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 POPDC2Q9HBU9 364 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 CENPMQ9NSP4 180 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 DNAJC11Q9NVH1 559 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 CAMK2AQ9UQM7 478 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 ASF1AQ9Y294 204 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 PADI2Q9Y2J8 665 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 ALG6Q9Y672 507 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 NEMP2A6NFY4 417 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 C19orf81C9J6K1 198 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 E5RGE8 158 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 UPK2O00526 184 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 PAGE4O60829 102 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 CREG1O75629 220 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 PARNO95453 639 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 H6PDO95479 791 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 PENKP01210 267 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 IGLV7-43P04211 117 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 APRTP07741 180 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 RAB40ALP0C0E4 278 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 GOLGA6DP0CG33 693 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 PRLRP16471 622 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 ADORA2BP29275 332 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 ABCD1P33897 745 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 GCKP35557 465 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 SLC6A8P48029 635 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 NEK2P51955 445 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 METAP1P53582 386 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 HCCSP53701 268 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 MAPK12P53778 367 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 RARSP54136 660 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 TAS2R19P59542 299 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 KCNJ2P63252 427 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD1B-201ENST00000363091 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms