RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 EFNB1P98172 346 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ACY1Q03154 408 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 IRF3Q14653 427 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SNAPC1Q16533 368 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 OCLNQ16625 522 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SLC27A4Q6P1M0 643 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 FAM26EQ8N5C1 309 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 AMER2Q8N7J2 671 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 IFI44Q8TCB0 444 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 FGF11Q92914 225 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SLC46A1Q96NT5 459 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 EVA1AQ9H8M9 152 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 C20orf141Q9NUB4 165 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 C14orf105Q9NVL8 296 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GWA3 101 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 DYRK3O43781 588 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 PPICP45877 212 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ST13P50502 369 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 MLLT10P55197 1068 aa16.49■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.231e-17■■□□□ 12.5
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF613Q6PF04 617 aa16.49■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 OR4Q3Q8NH05 313 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 DPH1Q9BZG8 443 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SMOC1Q9H4F8 434 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D23Q9NUY8 699 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 IL20RAQ9UHF4 553 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SRPK3Q9UPE1 567 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 HEATR5AQ86XA9 2040 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 A0A0B4J2E0 115 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GX12 115 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SERINC4A6NH21 518 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 M0R082 166 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ARHGAP33O14559 1287 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 PTHP01270 115 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 IFI30P13284 250 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CTF1Q16619 201 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 PLAG1Q6DJT9 500 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 LANCL3Q6ZV70 420 aa16.48■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 OSTF1Q92882 214 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 NAT6Q93015 286 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ADIPOR1Q96A54 375 aa16.48■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 IL20Q9NYY1 176 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 UNC119BA6NIH7 251 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 DAB2P98082 770 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 PRKCDQ05655 676 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SPCS2Q15005 226 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SYT14P1Q58G82 188 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SLC30A6Q6NXT4 461 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ZNF620Q6ZNG0 422 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 PRR22Q8IZ63 422 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 FCGR1BQ92637 280 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 LRR1Q96L50 414 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SAMD8Q96LT4 415 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 GAL3ST4Q96RP7 486 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 NRSN2Q9GZP1 204 aa16.47■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 GPR52Q9Y2T5 361 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 IL33O95760 270 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CER1O95813 267 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CH25HO95992 272 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CSTAP01040 98 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ADORA3P0DMS8 318 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 DBTP11182 482 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 PIPP12273 146 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CKMT1AP12532 417 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 TGFBR2P37173 567 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 LIPAP38571 399 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ZNF91Q05481 1191 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 KLHL26Q53HC5 615 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A30Q5SVS4 291 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ZNF550Q7Z398 422 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CADM2Q8N3J6 435 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 GATSQ8NAP1 163 aa16.47■□□□□ 0.23
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