RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAT5AP42229 794 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GIPRP48546 466 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MVKQ03426 396 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR88Q6ZMY6 472 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C9orf40Q8IXQ3 194 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SVOPQ8N4V2 548 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGBL5Q8NDL9 886 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC90BQ9GZT6 254 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APMAPQ9HDC9 416 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBQLN4Q9NRR5 601 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNIH4Q9P003 139 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa20.15■□□□□ 0.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 M0R129 80 aa20.14■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FLRT2O43155 660 aa20.14■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHP2O43745 196 aa20.14■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCKP27707 260 aa20.14■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LANCL3Q6ZV70 420 aa20.14■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AHSA2Q719I0 299 aa20.14■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRGPREQ86SM8 312 aa20.14■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF527Q8NB42 609 aa20.14■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C17orf47Q8NEP4 570 aa20.14■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LMF1Q96S06 567 aa20.14■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC26A1Q9H2B4 701 aa20.14■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLN6Q9NWW5 311 aa20.14■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFCAB7A8K855 629 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IDSB3KWA1 339 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAM11O75078 769 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MT-ND2P03891 347 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYC1P08574 325 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR143P51810 404 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMSP52788 366 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSPHP78330 225 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FNDC7Q5VTL7 733 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF440Q8IYI8 595 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLDN22Q8N7P3 220 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM71CQ8NEG0 241 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEX47Q8TBZ9 253 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAR1Q8WVX9 515 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM239Q8WW34 195 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYDGFQ969H8 173 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ISOC1Q96CN7 298 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COPS4Q9BT78 406 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WWTR1Q9GZV5 400 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LHPPQ9H008 270 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FLRT3Q9NZU0 649 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LNP1A1A4G5 178 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIP5K1CO60331 668 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRMUO75648 421 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSTAP01040 98 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GINS1Q14691 196 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC25A30Q5SVS4 291 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC29A4Q7RTT9 530 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF441Q8N8Z8 693 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GGHQ92820 318 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HS6ST2Q96MM7 605 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 Q96MT0 163 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DOK1Q99704 481 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF426Q9BUY5 554 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EGLN3Q9H6Z9 239 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC24A3Q9HC58 644 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL20Q9NYY1 176 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPEGQ15772 3267 aa20.13■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DMDP11532 3685 aa20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1B0GWA3 101 aa20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGRPO00253 132 aa20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HEXBP07686 556 aa20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFNB1P98172 346 aa20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRKCDQ05655 676 aa20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD37Q7Z713 158 aa20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OSTF1Q92882 214 aa20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF31Q96EP0 1072 aa20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GAL3ST4Q96RP7 486 aa20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALOX12BO75342 701 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK1P06493 297 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM34P42696 430 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR4P46093 362 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MASP1P48740 699 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCYT1AP49585 367 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTBP2P56545 445 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OCLNQ16625 522 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF620Q6ZNG0 422 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IQCF1Q8N6M8 205 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR8D4Q8NGM9 314 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSPBAP1Q96EW2 488 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms