RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291547.9

PKNOX1-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX1, Length 5,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1-201ENST00000291547 MEIS3P1A6NDR6 274 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 MEIS3P2A8K0S8 358 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 E9PI62 339 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 PPP1R3DO95685 299 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 BMP4P12644 408 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 RNH1P13489 461 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 HRH2P25021 359 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 TAS2R38P59533 333 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 IL13RA1P78552 427 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 BAMBIQ13145 260 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 TMEM41BQ5BJD5 291 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 METTL4Q8N3J2 472 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 IL17RCQ8NAC3 791 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 HAS2Q92819 552 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 RANBP9Q96S59 729 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF559Q9BR84 538 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 BET1O15155 118 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 EDIL3O43854 480 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 C6P13671 934 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 CXADRP78310 365 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 MAP4K2Q12851 820 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 OR4D1Q15615 310 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 TATDN3Q17R31 274 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 BCL7AQ4VC05 210 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF440Q8IYI8 595 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 OR5W2Q8NH69 310 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 GPR148Q8TDV2 347 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 MAP6Q96JE9 813 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 HHIPL1Q96JK4 782 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 NT5DC2Q9H857 520 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 WASH6PQ9NQA3 447 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 KLHL13Q9P2N7 655 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 SIX4Q9UIU6 781 aa10.14□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 A0A0U1RQF3 1178 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 CLN5O75503 358 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 SEC14L2O76054 403 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ACPPP15309 386 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ACRV1P26436 265 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ZXDBP98169 803 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 GPR17Q13304 367 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 C22orf15Q8WYQ4 148 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ZBTB8AQ96BR9 441 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF778Q96MU6 729 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC25A18Q9H1K4 315 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 CNIH4Q9P003 139 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 KIF25Q9UIL4 384 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 VSTM2BA6NLU5 285 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 PIP5K1CO60331 668 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 LEFTY1O75610 366 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 NDUFB2O95178 105 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ACRP10323 421 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 KCNE1P15382 129 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 BEX5Q5H9J7 111 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 RAET1LQ5VY80 246 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 CYS1Q717R9 158 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF417Q8TAU3 575 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 RNF128Q8TEB7 428 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 CREB3L4Q8TEY5 395 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 MICU1Q9BPX6 476 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 FBXO8Q9NRD0 319 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 GPRC5BQ9NZH0 403 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ARAFP10398 606 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF425Q6IV72 752 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 NXPE4Q6UWF7 544 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF546Q86UE3 836 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF100Q8IYN0 542 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 NAGSQ8N159 534 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 GPR137CQ8N3F9 429 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC7A13Q8TCU3 470 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 NOX3Q9HBY0 568 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 IL37Q9NZH6 218 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 COPS3Q9UNS2 423 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 FEZF1A0PJY2 475 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 FAM221BA6H8Z2 402 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 CD300LBA8K4G0 201 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 SCGB1D1O95968 90 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 KEAP1Q14145 624 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 HYAL4Q2M3T9 481 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 IER5LQ5T953 404 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 FCRLBQ6BAA4 426 aa10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF461Q8TAF7 563 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms