RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 APLNRP35414 380 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 NOX3Q9HBY0 568 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 PPP1R3DO95685 299 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 C22orf39Q6P5X5 142 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 SSX7Q7RTT5 188 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 RAB39BQ96DA2 213 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 AIG1Q9NVV5 245 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 NUP188Q5SRE5 1749 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 NUDT1P36639 197 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 P2RY14Q15391 338 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 MICAQ29983 383 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 PTCHD1Q96NR3 888 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 TRIB3Q96RU7 358 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 LAMB4A4D0S4 1761 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 RFXAPO00287 272 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 EOMESO95936 686 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 HBE1P02100 147 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 BMP4P12644 408 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 CPT2P23786 658 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 C4orf17Q53FE4 359 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 OR52E8Q6IFG1 317 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 DEFB118Q96PH6 123 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 GON7Q9BXV9 100 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 EHFQ9NZC4 300 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 SLC23A2Q9UGH3 650 aa8.77□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 OR5H15A6NDH6 313 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 OR5H14A6NHG9 310 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 OR5H1A6NKK0 313 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 VEGFDO43915 354 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 OMGP23515 440 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 MMP12P39900 470 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 ARHGAP1Q07960 439 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 HACD4Q5VWC8 232 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 APOOLQ6UXV4 268 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 CSNK1A1LQ8N752 337 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 FCRL1Q96LA6 429 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 HOXD1Q9GZZ0 328 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 PXDNQ92626 1479 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 TMEM235A6NFC5 223 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 ZNF92Q03936 586 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 FBXW12Q6X9E4 464 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 GPR148Q8TDV2 347 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 KCNK12Q9HB15 430 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 KCNK6Q9Y257 313 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 DAP3P51398 398 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 AKR1C1Q04828 323 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 TNK1Q13470 666 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 CDONQ4KMG0 1287 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 NIPAL2Q9H841 368 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 SIX4Q9UIU6 781 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 SLC16A5O15375 505 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 SOCS5O75159 536 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.76□□□□□ -1.01
TNS1-201ENST00000171887 F5H5K5 113 aa8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms