RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

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Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 COMMD2Q86X83 199 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MUL1Q969V5 352 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 OR2A5Q96R48 311 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.99□□□□□ -1.29
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PKP4-217ENST00000628904 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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PKP4-217ENST00000628904 GDF9O60383 454 aa6.99□□□□□ -1.29
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PKP4-217ENST00000628904 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 SLC22A1O15245 554 aa6.98□□□□□ -1.29
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PKP4-217ENST00000628904 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.98□□□□□ -1.29
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PKP4-217ENST00000628904 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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PKP4-217ENST00000628904 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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PKP4-217ENST00000628904 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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PKP4-217ENST00000628904 RTL10Q7L3V2 364 aa6.98□□□□□ -1.29
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PKP4-217ENST00000628904 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.98□□□□□ -1.29
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PKP4-217ENST00000628904 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TMEM239Q8WW34 195 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 COQ7Q99807 217 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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