RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 MIPOL1Q8TD10 442 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 LRRC46Q96FV0 321 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 C7orf26Q96N11 449 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 CCDC115Q96NT0 180 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 OR7D2Q96RA2 312 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 TM9SF2Q99805 663 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 TRIM8Q9BZR9 551 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ACBD3Q9H3P7 528 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 FBXO34Q9NWN3 711 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 CLCF1Q9UBD9 225 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 BTNL2Q9UIR0 455 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 GPR45Q9Y5Y3 372 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ITPR2Q14571 2701 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 OR2M5A3KFT3 312 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 C7orf72A4D263 438 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 CLCA1A8K7I4 914 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 H3BNH8 94 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 HCRTR2O43614 444 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 PGRP06401 933 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 PRF1P14222 555 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 MATN1P21941 496 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 BMP5P22003 454 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 CTSSP25774 331 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 STARP49675 285 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ASCL1P50553 236 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF136P52737 540 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 DGKQP52824 942 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ATP12AP54707 1039 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 NME5P56597 212 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 UFM1P61960 85 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 PHC1P78364 1004 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 SAXO2Q658L1 398 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 MAVSQ7Z434 540 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 C9orf106Q8NAJ2 232 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 GATSQ8NAP1 163 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 OR5D16Q8NGK9 328 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 WNT2BQ93097 391 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 NEURL3Q96EH8 262 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 C14orf79Q96F83 325 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 TEX37Q96LM6 180 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 SERHL2Q9H4I8 314 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 EXD2Q9NVH0 621 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 STOML1Q9UBI4 398 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 NPIPB9F8W1W9 429 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF195O14628 629 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 RCBTB2O95199 551 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 TGDSO95455 350 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 IL18BPO95998 194 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 IL6P05231 212 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 GUSBP08236 651 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 IL12AP29459 219 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 OPRM1P35372 400 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 KHKP50053 298 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 CD226Q15762 336 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 PLPPR5Q32ZL2 321 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 KLHL26Q53HC5 615 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ARSKQ6UWY0 536 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 C16orf62Q7Z3J2 963 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 UBQLNLQ8IYU4 475 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 DYDC1Q8WWB3 177 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 OIT3Q8WWZ8 545 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 SDF2Q99470 211 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 SLC35A5Q9BS91 424 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF350Q9GZX5 532 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 OR51I1Q9H343 314 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 POLE3Q9NRF9 147 aa9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-209ENST00000620074 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.2 ms