RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 H1F0P07305 194 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF136P52737 540 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 IST1P53990 364 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 FNDC7Q5VTL7 733 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC9Q8WXX5 260 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 TMCO6Q96DC7 493 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 MCHR1Q99705 422 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 FNDC11Q9BVV2 318 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD19PQ9H560 264 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 USE1Q9NZ43 259 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
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CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PRQ8 180 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ALG1L2C9J202 215 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 UGT2B11O75310 529 aa28.51■■■□□ 2.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH3A2P51648 485 aa28.51■■■□□ 2.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 DGCR6Q14129 220 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM71CQ8NEG0 241 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4C15Q8NGM1 316 aa28.51■■■□□ 2.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 IL17BQ9UHF5 180 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 PCSK5Q92824 1860 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 EI24O14681 340 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5F1O95221 314 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO45P0C2W1 286 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 THRBP10828 461 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R41P59536 307 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ST3GAL3Q11203 375 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 GANABQ14697 944 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT4Q8N4A0 578 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC5A8Q8N695 610 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF597Q96LX8 424 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 RASL10BQ96S79 203 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 PSD2Q9BQI7 771 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF559Q9BR84 538 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ARRDC5A6NEK1 342 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 FRS3O43559 492 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 TPST2O60704 377 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2J2O76002 312 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 CLK3P49761 638 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 AQP4P55087 323 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP2R2BQ00005 443 aa28.49■■■□□ 2.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 H3F3CQ6NXT2 135 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 OPN5Q6U736 354 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 MISPQ8IVT2 679 aa28.49■■■□□ 2.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 TMCC3Q9ULS5 477 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 UBL4AP11441 157 aa28.48■■■□□ 2.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 LYPD8Q6UX82 237 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 GIPC3Q8TF64 312 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 FLRT3Q9NZU0 649 aa28.48■■■□□ 2.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 EVI2BP34910 448 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP1A4Q13733 1029 aa28.47■■■□□ 2.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 TBPL2Q6SJ96 375 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
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CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 HGDQ93099 445 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ALPK1Q96QP1 1244 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM2Q9C040 744 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 TRABD2BA6NFA1 517 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF264O43296 627 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 LIFP15018 202 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-206ENST00000588815 RFX4Q33E94 735 aa28.46■■■□□ 2.15
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