RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CPMP14384 443 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 PORP16435 677 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 RUNX2Q13950 521 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 EIPR1Q53HC9 387 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 MFSD4BQ5TF39 518 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM164Q5U3C3 297 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ADCK1Q86TW2 530 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 AGBL5Q8NDL9 886 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 PMEPA1Q969W9 287 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 TAAR9Q96RI9 348 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF232Q9UNY5 417 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP1B1P05026 303 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 FUT4P22083 530 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 LIPAP38571 399 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 CLK1P49759 484 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK5Q00535 292 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 LY6DQ14210 128 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 C16orf87Q6PH81 154 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ZER1Q7Z7L7 766 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC15A4Q8N697 577 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35A4Q96G79 324 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 POLE3Q9NRF9 147 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 H3BN98 237 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 P2RX6O15547 441 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 MAN1A2O60476 641 aa23.6■■□□□ 1.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 CYP7B1O75881 506 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5F1O95221 314 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 NADKO95544 446 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 MMP11P24347 488 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 POU1F1P28069 291 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 SMSP52788 366 aa23.6■■□□□ 1.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 MLLT10P55197 1068 aa23.6■■□□□ 1.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM44Q2T9K0 475 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 NIPAL1Q6NVV3 410 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM73Q86UV7 250 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 COMTD1Q86VU5 262 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10G6Q8NH81 332 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 NDNFQ8TB73 568 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 DIO2Q92813 273 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 STACQ99469 402 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 YIPF4Q9BSR8 244 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 MMP27Q9H306 513 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 PIGUQ9H490 435 aa23.6■■□□□ 1.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 H0YGG7 62 aa23.59■■□□□ 1.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 TUBA3EQ6PEY2 450 aa23.59■■□□□ 1.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 OOSP2Q86WS3 158 aa23.59■■□□□ 1.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR7G2Q8NG99 324 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52P1PQ8NH57 321 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM80Q96HE8 168 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 WFDC6Q9BQY6 131 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 SIAEQ9HAT2 523 aa23.59■■□□□ 1.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 OCIAD1Q9NX40 245 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNE3Q9Y6H6 103 aa23.59■■□□□ 1.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAM227AF5H4B4 570 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 DUX1O43812 170 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 OPRL1P41146 370 aa23.58■■□□□ 1.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 PCYT1AP49585 367 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 RGS6P49758 472 aa23.58■■□□□ 1.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 DUSP8Q13202 625 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 DEFB134Q4QY38 66 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ARMCX4Q5H9R4 360 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 FHL5Q5TD97 284 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 FRRS1Q6ZNA5 592 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 VASH2Q86V25 355 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 MINDY2Q8NBR6 621 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 CHPT1Q8WUD6 406 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
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