RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 PIGWQ7Z7B1 504 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TMED4Q7Z7H5 227 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PIM3Q86V86 326 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 IGFN1Q86VF2 1251 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 NAXDQ8IW45 347 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 NRMQ8IXM6 262 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 C4orf19Q8IY42 314 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 YAF2Q8IY57 180 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 APCDD1Q8J025 514 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 EID3Q8N140 333 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 GABRG1Q8N1C3 465 aa2.83□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 PARP8Q8N3A8 854 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SVOPLQ8N434 492 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC18Q8N456 261 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO36Q8NEA4 188 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CADM4Q8NFZ8 388 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TSPAN14Q8NG11 270 aa2.83□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 OR13C5Q8NGS8 318 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OR11L1Q8NGX0 322 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OCC1Q8TAD7 63 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 BPIFB1Q8TDL5 484 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 C16orf78Q8WTQ4 265 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 NR4A3Q92570 626 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 NRGNQ92686 78 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ARRDC3Q96B67 414 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CMTM5Q96DZ9 223 aa2.83□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 KLHL15Q96M94 604 aa2.83□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 PRAP1Q96NZ9 151 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SLC38A2Q96QD8 506 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OR5M11Q96RB7 305 aa2.83□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 RTP3Q9BQQ7 232 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 MED18Q9BUE0 208 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PDCD10Q9BUL8 212 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 C20orf24Q9BUV8 137 aa2.83□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF532Q9HCE3 1301 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGEF10O15013 1369 aa2.83□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 CHD5Q8TDI0 1954 aa2.83□□□□□ -1.96
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