RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRG2P13727 222 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCMT1P22061 227 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 HTR2AP28223 471 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 OMPP47874 163 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 TSPAN31Q12999 210 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 FGFBP1Q14512 234 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 NSDHLQ15738 373 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 NKAIN4Q8IVV8 208 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC2A12Q8TD20 617 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF559Q9BR84 538 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR10H1Q9Y4A9 318 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM20BO75063 409 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 LYPD3O95274 346 aa26.25■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ITIH1P19827 911 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 NEDD8Q15843 81 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM236Q5W0B7 351 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 NAXDQ8IW45 347 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF540Q8NDQ6 660 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR13F1Q8NGS4 319 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 PIGXQ8TBF5 258 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRSS27Q9BQR3 290 aa26.25■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF292O60281 2723 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEC14L2O76054 403 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 POU1F1P28069 291 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR1Q1Q15612 314 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF613Q6PF04 617 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 RRM2BQ7LG56 351 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC38A9Q8NBW4 561 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa26.25■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC7A7Q9UM01 511 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 SH3D21A4FU49 640 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 KLF4O43474 513 aa26.24■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MKL2Q9ULH7 1088 aa26.24■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-210ENST00000574322 D6RAR5 112 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 H3BN98 237 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCRG1O75711 98 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 SOX14O95416 240 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 FPR3P25089 353 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 RFX3P48380 749 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 MUL1Q969V5 352 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADIPOR1Q96A54 375 aa26.23■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC160A6NGH7 325 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 A8MUA0 341 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 RGS10O43665 173 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 TIAF1O95411 115 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CDK5Q00535 292 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 STT3BQ8TCJ2 826 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 TSC22D3Q99576 134 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A19Q9HC21 320 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLCA1A8K7I4 914 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL33O95760 270 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 FGF5P12034 268 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 LCN1P31025 176 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 GIPRP48546 466 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM201Q5SNT2 666 aa26.22■■□□□ 1.79
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTCHD4Q6ZW05 846 aa26.22■■□□□ 1.79
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