RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169		A0A1W2PRB8	838 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	NDUFB5	O43674	189 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	NGFR	P08138	427 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	IFI6	P09912	130 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	HMOX2	P30519	316 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	MAP3K8	P41279	467 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	CARD18	P57730	90 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	C2orf80	Q0P641	193 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	P2RY6	Q15077	328 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	NRF1	Q16656	503 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TRABD2A	Q86V40	505 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	OR4C3	Q8NH37	302 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	POC1B	Q8TC44	478 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	METTL6	Q8TCB7	284 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	RNF128	Q8TEB7	428 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ABHD3	Q8WU67	409 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	KLHL15	Q96M94	604 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	FUT8	Q9BYC5	575 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GP6	Q9HCN6	339 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	MED17	Q9NVC6	651 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM160	Q9NX00	188 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SERTM1	A2A2V5	107 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SHISA9	B4DS77	424 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SSX4	O60224	188 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	RAMP1	O60894	148 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SUPT7L	O94864	414 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	NKX2-2	O95096	273 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	KCNH1	O95259	989 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	NTN1	O95631	604 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ADA	P00813	363 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	INHBA	P08476	426 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ME2	P23368	584 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SHC1	P29353	583 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	PHB	P35232	272 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	THBS2	P35442	1172 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SERPINB9	P50453	376 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	VLDLR	P98155	873 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SLC18A2	Q05940	514 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	BTK	Q06187	659 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ITGAD	Q13349	1161 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SLC29A2	Q14542	456 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	PIK3R3	Q92569	461 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ALG2	Q9H553	416 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	MYNN	Q9NPC7	610 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	FAM234B	A2RU67	622 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	EFNA2	O43921	213 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	LINGO3	P0C6S8	592 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	NTS	P30990	170 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	C21orf58	P58505	322 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	DSCR9	P59020	149 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TDRP	Q86YL5	185 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	LILRA2	Q8N149	483 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	CEP112	Q8N8E3	955 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	BANP	Q8N9N5	519 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GATS	Q8NAP1	163 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ELOA3	Q8NG57	546 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	FAM110B	Q8TC76	370 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GPR151	Q8TDV0	419 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79

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