RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567491.1

SH3RF3-AS1-201, SH3RF3 antisense RNA 1, humanhuman

BASIC

Gene SH3RF3-AS1, Length 1,604 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ZNF766Q5HY98 468 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TBCELQ5QJ74 424 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SLC25A25Q6KCM7 469 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SLC30A6Q6NXT4 461 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ASB18Q6ZVZ8 466 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SPPL2CQ8IUH8 684 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RASSF5Q8WWW0 418 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TPD52L3Q96J77 140 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ANGPTL4Q9BY76 406 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TUBD1Q9UJT1 453 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SLC13A4Q9UKG4 626 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TRAV17A0A0B4J275 112 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 A0A0G2JMM0 328 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 A0A1W2PPB8 328 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 A0A1W2PRS3 328 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 C17orf51A8MQB3 221 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 KIR3DP1A8MWS1 328 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ACOT8O14734 319 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 NME2P1O60361 137 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CSTAP01040 98 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 UBL4AP11441 157 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 NME2P22392 152 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PRKAR1BP31321 381 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 MASP1P48740 699 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DNASE1L1P49184 302 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 EIPR1Q53HC9 387 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 LCN8Q6JVE9 175 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TMEM178AQ8NBL3 297 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PINK1Q9BXM7 581 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TRIM15Q9C019 465 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RLIMQ9NVW2 624 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 V9GYQ6 96 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 USP24Q9UPU5 2620 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ANKRD33BA6NCL7 494 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SUV39H1O43463 412 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TPST1O60507 370 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DPM1O60762 260 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CYP7B1O75881 506 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 GAS1P54826 345 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DUSP7Q16829 419 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RNF220Q5VTB9 566 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 FNDC7Q5VTL7 733 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PACS2Q86VP3 889 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 LZICQ8WZA0 190 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SCMH1Q96GD3 660 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RNF145Q96MT1 663 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 MFRPQ9BY79 579 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ARMC7Q9H6L4 198 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PROK2Q9HC23 129 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SDHAF3Q9NRP4 125 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DEPPQ9NTK1 212 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 NCKAP5O14513 1909 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CD247P20963 164 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CNR1P21554 472 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 OR5M10Q6IEU7 315 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CBLL1Q75N03 491 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 MISPQ8IVT2 679 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CMIPQ8IY22 773 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CLIP4Q8N3C7 705 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DUSP19Q8WTR2 217 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 BAG5Q9UL15 447 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CDHR4A6H8M9 788 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CFAP73A6NFT4 308 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ADAM10O14672 748 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ZNF264O43296 627 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 HCRTR2O43614 444 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 GMFGO60234 142 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SNX4O95219 450 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 FESP07332 822 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 KCNJ5P48544 419 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ERFP50548 548 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CCR4P51679 360 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 C17orf67Q0P5P2 114 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms