RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	SLC1A6	P48664	564 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HNMT	P50135	292 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GPR143	P51810	404 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ART1	P52961	327 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MFAP4	P55083	255 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FOXA1	P55317	472 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	AP1S2	P56377	157 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ISL1	P61371	349 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GNGT1	P63211	74 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SNTA1	Q13424	505 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KEAP1	Q14145	624 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PDK4	Q16654	411 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GPR180	Q86V85	440 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EID2	Q8N6I1	236 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LCN9	Q8WX39	176 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC126	Q96EE4	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SORT1	Q99523	831 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DRC3	Q9H069	523 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF225	Q9UK10	706 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		K7EPI3	171 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CTDSP2	O14595	271 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF195	O14628	629 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CLGN	O14967	610 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KCNAB3	O43448	404 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DFNA5	O60443	496 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR4F21	O95013	312 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HSPA4L	O95757	839 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RPN2	P04844	631 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FGF4	P08620	206 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ERG	P11308	486 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SELL	P14151	372 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MYOD1	P15172	320 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PSMB5	P28074	263 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HSD17B2	P37059	387 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	NBL1	P41271	181 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FASLG	P48023	281 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RAB28	P51157	221 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR1D5	P58170	312 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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