RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560631.1

RNF31-222, Transcript of ring finger protein 31, human

TSL 2

Gene RNF31, Length 320 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF31-222	ENST00000560631	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	WDR45	Q9Y484	360 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631		A0A087WZY1	265 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	LINC01387	J3KSC0	135 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SCD	O00767	359 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PRRG2	O14669	202 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	NDUFB5	O43674	189 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SCO2	O43819	266 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	FCMR	O60667	390 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CCDC22	O60826	627 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	TNFRSF21	O75509	655 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ACTL6A	O96019	429 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CHRM4	P08173	479 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	HPGD	P15428	266 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	RFX3	P48380	749 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SEC24C	P53992	1094 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	GYS2	P54840	703 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CASP6	P55212	293 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	GFRA1	P56159	465 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	DSTN	P60981	165 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	GNGT1	P63211	74 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	MAPRE2	Q15555	327 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	MAPK11	Q15759	364 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	BCL2A1	Q16548	175 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SYPL1	Q16563	259 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	C3AR1	Q16581	482 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	EIPR1	Q53HC9	387 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	EMC4	Q5J8M3	183 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	VASN	Q6EMK4	673 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CMIP	Q8IY22	773 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	EID3	Q8N140	333 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	RAB8B	Q92930	207 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ARSG	Q96EG1	525 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CGREF1	Q99674	301 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	LDAH	Q9H6V9	325 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	MED11	Q9P086	117 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PTPN13	Q12923	2485 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	C7orf72	A4D263	438 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SERINC4	A6NH21	518 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	EVPLL	A8MZ36	301 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	AHRR	A9YTQ3	701 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631		E9PLN8	166 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631		H3BNH8	94 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	FBP2	O00757	339 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	WDR1	O75083	606 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	UGT2B17	O75795	530 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	TRAPPC6A	O75865	159 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PDE9A	O76083	593 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	H6PD	O95479	791 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	LDLR	P01130	860 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	TFPT	P0C1Z6	253 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	NPIPA8	P0DM63	369 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ARAF	P10398	606 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ETFA	P13804	333 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	GABRA1	P14867	456 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CPN1	P15169	458 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ABO	P16442	354 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	DPP4	P27487	766 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CRAT	P43155	626 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	P2RX1	P51575	399 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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