RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	OR2M7	Q8NG81	312 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	OR4C3	Q8NH37	302 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	NFKBID	Q8NI38	313 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	GRHL3	Q8TE85	626 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	LZIC	Q8WZA0	190 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF583	Q96ND8	569 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	FRMD6	Q96NE9	622 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	NODAL	Q96S42	347 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	STOML1	Q9UBI4	398 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SERINC4	A6NH21	518 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SNPH	O15079	494 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PDGFA	P04085	211 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CHRM4	P08173	479 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	UBL4A	P11441	157 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SLC6A8	P48029	635 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	MEOX1	P50221	254 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	KCNJ10	P78508	379 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC80	Q76M96	950 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	IFNE	Q86WN2	208 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CDRT15	Q96T59	188 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	NIN	Q8N4C6	2090 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730		A0A087WZY1	265 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF264	O43296	627 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SCO2	O43819	266 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	FCMR	O60667	390 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	UGT2B17	O75795	530 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	CSTA	P01040	98 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	C8B	P07358	591 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF24	P17028	368 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PRKAR1B	P31321	381 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SLC25A3	Q00325	362 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	FUT5	Q11128	374 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	FGFBP1	Q14512	234 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ADRM1	Q16186	407 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	RNF220	Q5VTB9	566 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF550	Q7Z398	422 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	AMER2	Q8N7J2	671 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	MAL2	Q969L2	176 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	BAG5	Q9UL15	447 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BBS1-224	ENST00000534730	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	TTLL8	A6PVC2	850 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	LINC01387	J3KSC0	135 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730		K7EM74	188 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	NME4	O00746	187 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	HCRTR2	O43614	444 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	NUDT7	P0C024	238 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	GP1BB	P13224	206 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	CPOX	P36551	454 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	GSK3B	P49841	420 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	GZMM	P51124	257 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	CBFB	Q13951	182 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	SELPLG	Q14242	412 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BBS1-224	ENST00000534730	NADK2	Q4G0N4	442 aa		13.95	□□□□□ -0.18

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