RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531857.1

PKP3-208, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 4

Gene PKP3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-208ENST00000531857 MYO1GB0I1T2 1018 aa15.5■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 RNF223E7ERA6 249 aa15.5■□□□□ 0.07
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PKP3-208ENST00000531857 PLIN3O60664 434 aa15.5■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 KRT6AP02538 564 aa15.5■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 KRT6BP04259 564 aa15.5■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 JUNP05412 331 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
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PKP3-208ENST00000531857 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
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PKP3-208ENST00000531857 UNC50Q53HI1 259 aa15.5■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 ACSM2BQ68CK6 577 aa15.5■□□□□ 0.07
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PKP3-208ENST00000531857 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
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PKP3-208ENST00000531857 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
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PKP3-208ENST00000531857 ACTR6Q9GZN1 396 aa15.49■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
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PKP3-208ENST00000531857 TIMM22Q9Y584 194 aa15.48■□□□□ 0.07
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PKP3-208ENST00000531857 ALKBH2Q6NS38 261 aa15.47■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 HOMEZQ8IX15 550 aa15.47■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 OR2L13Q8N349 312 aa15.47■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 CDC26Q8NHZ8 85 aa15.47■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 SLC9A6Q92581 669 aa15.47■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 ELP4Q96EB1 424 aa15.47■□□□□ 0.07
PKP3-208ENST00000531857 ADGRG7Q96K78 797 aa15.47■□□□□ 0.07
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