RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ARTNQ5T4W7 220 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MTFR2Q6P444 385 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 QSOX2Q6ZRP7 698 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TCEANCQ8N8B7 351 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TEX47Q8TBZ9 253 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NELL1Q92832 810 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CXorf40BQ96DE9 158 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ABHD1Q96SE0 405 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 OR2AG1Q9H205 316 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SLC6A5Q9Y345 797 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TTLL8A6PVC2 850 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MPTX1A8MV57 137 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TAPBPO15533 448 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PCDH7O60245 1069 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SOD1P00441 154 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SDC1P18827 310 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 IDSP22304 550 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CTSCP53634 463 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ACVR1Q04771 509 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NCF4Q15080 339 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CHRNA6Q15825 494 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 GAB4Q2WGN9 574 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SLC6A19Q695T7 634 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZTK2 550 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SHFQ7M4L6 423 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NRSN1Q8IZ57 195 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 RNF175Q8N4F7 328 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TMED9Q9BVK6 235 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 EBPLQ9BY08 206 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PHF11Q9UIL8 331 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PQF6 199 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 L7N2F9 121 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DPM1O60762 260 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 AHCYP23526 432 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CLDN2P57739 230 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CRB2Q5IJ48 1285 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 IQCF1Q8N6M8 205 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 LMX1AQ8TE12 382 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PCED1AQ9H1Q7 454 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DPAGT1Q9H3H5 408 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ACER3Q9NUN7 267 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SNAPINO95295 136 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CD3GP09693 182 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SPP1P10451 314 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ACTR1BP42025 376 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SPINT3P49223 89 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NUBP1P53384 320 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ACTR1AP61163 376 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SLC36A2Q495M3 483 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZSR6 202 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SYT12Q8IV01 421 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SLC30A8Q8IWU4 369 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 KCNJ9Q92806 393 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 WNT2BQ93097 391 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CRB3Q9BUF7 120 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ACTR6Q9GZN1 396 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PLSCR5A0PG75 271 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PMS2P1A4D2B8 440 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 OR2AG2A6NM03 316 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 METTL12A8MUP2 240 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 D6RAR5 112 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms