RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNASE1L2Q92874 299 aa0□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UCN3Q969E3 161 aa0□□□□□ -2.41
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NRIP2Q9BQI9 281 aa0□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NLNQ9BYT8 704 aa0□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LHX5Q9H2C1 402 aa0□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AIG1Q9NVV5 245 aa0□□□□□ -2.41
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGLV2-23P01705 113 aa-0.01□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL4P36578 427 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIR2DS4P43632 304 aa-0.01□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NMUP48645 174 aa-0.01□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAD23AP54725 363 aa-0.01□□□□□ -2.41
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL8P62917 257 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HERV-K104P63124 156 aa-0.01□□□□□ -2.41
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC34A1Q06495 639 aa-0.01□□□□□ -2.41
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NFE2L1Q14494 772 aa-0.01□□□□□ -2.41
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TEX19Q8NA77 164 aa-0.01□□□□□ -2.41
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM114A2Q9NRY5 505 aa-0.01□□□□□ -2.41
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAB21L2Q9Y586 359 aa-0.01□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa-0.01□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEC16AO15027 2179 aa-0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa-0.02□□□□□ -2.41
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLCEO94923 617 aa-0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC4A1P02730 911 aa-0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSF2P04141 144 aa-0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADRA2AP08913 450 aa-0.02□□□□□ -2.41
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACADSBP45954 432 aa-0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAPZA1P52907 286 aa-0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RND3P61587 244 aa-0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPIBQ01892 262 aa-0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BNIP1Q12981 228 aa-0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BAMBIQ13145 260 aa-0.02□□□□□ -2.41
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