RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM20BO75063 409 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 GNSP15586 552 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 PNLIPP16233 465 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 TNNI3P19429 210 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 PEX19P40855 299 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ARHGDIAP52565 204 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 LIMK1P53667 647 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 EMP3P54852 163 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 NUP107P57740 925 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 TAS2R41P59536 307 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 FGFBP1Q14512 234 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF141Q15928 474 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 NDUFA9Q16795 377 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 TRIM61Q5EBN2 209 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 BROXQ5VW32 411 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 KIRREL2Q6UWL6 708 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 CD300LDQ6UXZ3 194 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC00114Q6XXX2 140 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 QSOX2Q6ZRP7 698 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 MRGPREQ86SM8 312 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 GATSQ8NAP1 163 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 RASSF5Q8WWW0 418 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 MPP4Q96JB8 637 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 OR5M11Q96RB7 305 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 NODALQ96S42 347 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 FUNDC2Q9BWH2 189 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 HCAR1Q9BXC0 346 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 OCEL1Q9H607 264 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 CLEC2DQ9UHP7 191 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 MGAT4BQ9UQ53 548 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 GPR52Q9Y2T5 361 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ORC6Q9Y5N6 252 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF318Q5VUA4 2279 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A0B4J2E0 115 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A1B0GX12 115 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A1B0GX78 115 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A1W2PPW3 197 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 DUXAA6NLW8 204 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 APOL3O95236 402 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ANKRD34CP0C6C1 535 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 CKMT1AP12532 417 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 CCL4P13236 92 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ITIH1P19827 911 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 RORAP35398 523 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 LIPAP38571 399 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 EBPQ15125 230 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 GXYLT1Q4G148 440 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 KLHL26Q53HC5 615 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ATAD3BQ5T9A4 648 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC23A3Q6PIS1 610 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 TAGAPQ8N103 731 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF540Q8NDQ6 660 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM71CQ8NEG0 241 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 OR4D9Q8NGE8 314 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 GRHL3Q8TE85 626 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF426Q9BUY5 554 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 YIPF2Q9BWQ6 316 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 DPH1Q9BZG8 443 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF304Q9HCX3 659 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 CBLCQ9ULV8 474 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 SPACA6W5XKT8 324 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM86C2PA6NEL3 165 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ARHGAP33O14559 1287 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 GNB5O14775 395 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 CH25HO95992 272 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 CDK1P06493 297 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 DBIP07108 87 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 CELA2AP08217 269 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 FBLP22087 321 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 CXCR4P61073 352 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ESRRGP62508 458 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 DECR1Q16698 335 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 MINDY4Q4G0A6 757 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM201Q5SNT2 666 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-212ENST00000497037 RHBDD2Q6NTF9 364 aa4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms