RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SELPLGQ14242 412 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 RGNQ15493 299 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ZNF141Q15928 474 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.157e-7■■■■□ 23.2
PKP4-216ENST00000495123 GXYLT1Q4G148 440 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 EMC4Q5J8M3 183 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 CBLN3Q6UW01 205 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ARSKQ6UWY0 536 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 DHDDSQ86SQ9 333 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 DPP10Q8N608 796 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ZNF614Q8N883 585 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ZNF511Q8NB15 262 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 OR14L1PQ8NHC6 308 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 TSPEARQ8WU66 669 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 RELTQ969Z4 430 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SARAFQ96BY9 339 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ARSGQ96EG1 525 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 NPAS1Q99742 590 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 UGT2B28Q9BY64 529 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 TAS2R10Q9NYW0 307 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ARMCX1Q9P291 453 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 P2RX2Q9UBL9 471 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 CARD8Q9Y2G2 431 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 DTNAQ9Y4J8 743 aa7.85□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 A0A1B0GUH1 482 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SERINC4A6NH21 518 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 CLDN24A6NM45 220 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 BCKDKO14874 412 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 KRT34O76011 436 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 LDLRP01130 860 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 BCHEP06276 602 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 GUSBP08236 651 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 TFPTP0C1Z6 253 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 NR2F1P10589 423 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 BMP2P12643 396 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 MAGEA8P43361 318 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 STARP49675 285 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 CASP6P55212 293 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 GFRA1P56159 465 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 HPCAP84074 193 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ADORA2A-AS1P86434 159 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 PLAURQ03405 335 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 FADDQ13158 208 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 NFYCQ13952 458 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 FGFBP1Q14512 234 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 GANABQ14697 944 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 WLSQ5T9L3 541 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 AP1ARQ63HQ0 302 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 REP15Q6BDI9 236 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 VASNQ6EMK4 673 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 IFNEQ86WN2 208 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SNX32Q86XE0 403 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 MISPQ8IVT2 679 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ZNF527Q8NB42 609 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SLC38A5Q8WUX1 472 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 MAL2Q969L2 176 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ZNF524Q96C55 264 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 CCDC120Q96HB5 630 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 TMEM19Q96HH6 336 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SFXN2Q96NB2 322 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 CGREF1Q99674 301 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 TIMP4Q99727 224 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 PTGES2Q9H7Z7 377 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 POLE3Q9NRF9 147 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 LIPT1Q9Y234 373 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 VDAC3Q9Y277 283 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 MEMO1Q9Y316 297 aa7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PKP4-216ENST00000495123 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms