RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487453.1

PRDM2-208, Transcript of PR/SET domain 2, human

TSL 3

Gene PRDM2, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRDM2-208	ENST00000487453	AGAP5	A6NIR3	686 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453		B2RBV5	119 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	TRAPPC6A	O75865	159 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	NUDT14	O95848	222 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	CELA3A	P09093	270 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	PCGF2	P35227	344 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ZNF117	Q03924	483 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	TLE1	Q04724	770 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	LIPE	Q05469	1076 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	FGFBP1	Q14512	234 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	VRK2	Q86Y07	508 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	OR2M3	Q8NG83	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ZG16B	Q96DA0	208 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	DSN1	Q9H410	356 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ALG2	Q9H553	416 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	EXO5	Q9H790	373 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	HHATL	Q9HCP6	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	MED11	Q9P086	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	CLDN24	A6NM45	220 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ADAM10	O14672	748 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ZNF264	O43296	627 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	CBR3	O75828	277 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	PDE9A	O76083	593 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	OPN1SW	P03999	348 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	T-ENOL	P0DO92	83 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	NID1	P14543	1247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	MST1	P26927	711 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	GSK3B	P49841	420 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	GZMM	P51124	257 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	RINL	Q6ZS11	566 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	MICU2	Q8IYU8	434 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	RNF148	Q8N7C7	305 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	PMM1	Q92871	262 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	NTNG2	Q96CW9	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ZNF583	Q96ND8	569 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ZNF607	Q96SK3	696 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	LDAH	Q9H6V9	325 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453		B4DXG7	233 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	GSTA4	O15217	222 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	OIP5	O43482	229 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	SERPINB7	O75635	380 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	THBS1	P07996	1170 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ETS2	P15036	469 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	DPP4	P27487	766 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	P2RX1	P51575	399 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	KCNJ10	P78508	379 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PRDM2-208	ENST00000487453	HSF1	Q00613	529 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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