RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482020.1

NFIA-211, Transcript of nuclear factor I A, human

TSL 3

Gene NFIA, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIA-211	ENST00000482020	CHN1	P15882	459 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	DDC	P20711	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	PTPN6	P29350	595 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	IL12B	P29460	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	CRHR1	P34998	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	TIMP3	P35625	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	EMD	P50402	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	HTR6	P50406	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	NAGLU	P54802	743 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	DNAJB13	P59910	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	HMGCS1	Q01581	520 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	DUSP2	Q05923	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	MYBPH	Q13203	477 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	EFR3A	Q14156	821 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	RCAN2	Q14206	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	LTB4R	Q15722	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	CEBPE	Q15744	281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	NNAT	Q16517	81 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	CES4A	Q5XG92	561 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	HGD	Q93099	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	APIP	Q96GX9	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	VSTM2L	Q96N03	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	COL21A1	Q96P44	957 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	TIMP4	Q99727	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	EMCN	Q9ULC0	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	CENPE	Q02224	2701 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFIA-211	ENST00000482020	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020		A0A087WV62	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	SYT5	O00445	386 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	COPE	O14579	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	RGS14	O43566	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	TSPAN2	O60636	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	PLIN3	O60664	434 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	REM1	O75628	298 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	ZWINT	O95229	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	CHEK2	O96017	543 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	SHBG	P04278	402 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	IFI6	P09912	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	UROS	P10746	265 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	NEFH	P12036	1026 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	CYP4B1	P13584	511 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	CPA3	P15088	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	CPN1	P15169	458 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	CPE	P16870	476 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	BMP5	P22003	454 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	NTS	P30990	170 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	PTGDS	P41222	190 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	SLCO1A2	P46721	670 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	ASCL1	P50553	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	BTK	Q06187	659 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	CD69	Q07108	199 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	PDCD1	Q15116	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFIA-211	ENST00000482020	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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