RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.4□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 IFT81Q8WYA0 676 aa8.4□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.4□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 STK38LQ9Y2H1 464 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-210ENST00000481231 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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SMARCE1-210ENST00000481231 A0A087WZY1 265 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-210ENST00000481231 C7orf72A4D263 438 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-210ENST00000481231 ALG1L2C9J202 215 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-210ENST00000481231 SYNGR4O95473 234 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-210ENST00000481231 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-210ENST00000481231 SLC22A9Q8IVM8 553 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-210ENST00000481231 GATSQ8NAP1 163 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-210ENST00000481231 GPR151Q8TDV0 419 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-210ENST00000481231 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-210ENST00000481231 MED17Q9NVC6 651 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 STOML1Q9UBI4 398 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR52Q9Y2T5 361 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-210ENST00000481231 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 DYSFO75923 2080 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0J9YW62 118 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 GOLGA8RI6L899 631 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 TNFSF11O14788 317 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFB5O43674 189 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 TCF21O43680 179 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 NKX2-2O95096 273 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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SMARCE1-210ENST00000481231 ABHD2P08910 425 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ME2P23368 584 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 SHC1P29353 583 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 AGTR1P30556 359 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 MAP3K8P41279 467 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 RAC1P63000 192 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC18A2Q05940 514 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 HSPB3Q12988 150 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC29A2Q14542 456 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 IMPG1Q17R60 797 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 CPTPQ5TA50 214 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 HBMQ6B0K9 141 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 MFSD12Q6NUT3 480 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 NOXRED1Q6NXP6 359 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 BEND4Q6ZU67 534 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 IKBIPQ70UQ0 350 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 FBXO30Q8TB52 745 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 POC1BQ8TC44 478 aa8.38□□□□□ -1.07
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