RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477347.1

RPSAP55-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 55, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP55, Length 876 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP55-201ENST00000477347 ITGA2P17301 1181 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 CCL11P51671 97 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 PNLIPRP2P54317 469 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 IL1RL1Q01638 556 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 PLAURQ03405 335 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 KCNC4Q03721 635 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 KCNAB2Q13303 367 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 MEP1AQ16819 746 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 RNF220Q5VTB9 566 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 OPN5Q6U736 354 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 LYPD8Q6UX82 237 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 APOOLQ6UXV4 268 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 HS3ST5Q8IZT8 346 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 POGLUT1Q8NBL1 392 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 OR2T29Q8NH02 315 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 HGDQ93099 445 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 RELTQ969Z4 430 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 TMCO6Q96DC7 493 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 C7orf34Q96L11 122 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 CIB1Q99828 191 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 HOXD1Q9GZZ0 328 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 LHPPQ9H008 270 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 IL1RAPQ9NPH3 570 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 HPF1Q9NWY4 346 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 GPR83Q9NYM4 423 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 DNAJB9Q9UBS3 223 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 WASF3Q9UPY6 502 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 POLHQ9Y253 713 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 SPEGQ15772 3267 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 CDHR4A6H8M9 788 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 TNFRSF11BO00300 401 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 TP53I11O14683 189 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 GNB5O14775 395 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 HCRTR2O43614 444 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 NTN1O95631 604 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 ANGPTL1O95841 491 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 FBXO45P0C2W1 286 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 TBXA2RP21731 343 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 FUT4P22083 530 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 ITPKBP27987 946 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 HTR2AP28223 471 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 CASRP41180 1078 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 MAGEA2P43356 314 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 RRADP55042 308 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 ZNF117Q03924 483 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 ACER2Q5QJU3 275 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 NUP54Q7Z3B4 507 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 GALNT16Q8N428 558 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 ZNF563Q8TA94 476 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 EME1Q96AY2 570 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 PRRC1Q96M27 445 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 PIP5K1AQ99755 562 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 BDH2Q9BUT1 245 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 FAM117AQ9C073 453 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 ABI3Q9P2A4 366 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 OAZ3Q9UMX2 235 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.98□□□□□ -0.97
RPSAP55-201ENST00000477347 EFSO43281 561 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms