RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 FIG4Q92562 907 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 PGM2Q96G03 612 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 DUSP26Q9BV47 211 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 PINK1Q9BXM7 581 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 RNF122Q9H9V4 155 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 GALNT8Q9NY28 637 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ASIC5Q9NY37 505 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 RAB21Q9UL25 225 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 SNX8Q9Y5X2 465 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 WDR91A4D1P6 747 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 SH3D21A4FU49 640 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 H0YC42 278 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 H3BNH8 94 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ADAMDEC1O15204 470 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CFLARO15519 480 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 SEC14L5O43304 696 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ITM2AO43736 263 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 C6orf47O95873 294 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CGAP01215 116 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CD8BP10966 210 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 G6PDP11413 515 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 FCGR2AP12318 317 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ATP6V1C1P21283 382 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ADH6P28332 368 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CD79BP40259 229 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 SLC1A6P48664 564 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ATP12AP54707 1039 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CLDN20P56880 219 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF844Q08AG5 666 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 FAM27E3Q08E93 113 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 PTGR1Q14914 329 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 PON3Q15166 354 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CHI3L2Q15782 390 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 KLHL26Q53HC5 615 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ZAR1Q86SH2 424 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 SMPDL3BQ92485 455 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 JADE3Q92613 823 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 NRGNQ92686 78 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 MBD6Q96DN6 1003 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 C1orf50Q9BV19 199 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 LIME1Q9H400 295 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 GLRX2Q9NS18 164 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 MED17Q9NVC6 651 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 VDAC3Q9Y277 283 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 C16orf97H3BN30 126 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 GMFGO60234 142 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 SYNGR4O95473 234 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 AGR2O95994 175 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 AK1P00568 194 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 HRGP04196 525 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 LINGO3P0C6S8 592 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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