RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF613Q6PF04 617 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 P2RY8Q86VZ1 359 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 WDR5BQ86VZ2 330 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 KMT5CQ86Y97 462 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 P3H2Q8IVL5 708 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 PEX5LQ8IYB4 626 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 MFSD4AQ8N468 514 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 IQCF1Q8N6M8 205 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 LSMEM1Q8N8F7 131 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 COX18Q8N8Q8 333 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 OR1L3Q8NH93 324 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 NDNFQ8TB73 568 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 PIGXQ8TBF5 258 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM163Q8TC26 289 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 DOK4Q8TEW6 326 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM255BQ8WV15 326 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 COL26A1Q96A83 441 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CRELD1Q96HD1 420 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SPACA7Q96KW9 195 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 OPALINQ96PE5 141 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 OR1F2PQ96R84 312 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 OR5M11Q96RB7 305 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SLC38A3Q99624 504 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ITPAQ9BY32 194 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 DSN1Q9H410 356 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 EGLN3Q9H6Z9 239 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 HHATLQ9HCP6 504 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 PDE7BQ9NP56 450 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 AMBNQ9NP70 447 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf16Q9NQ32 467 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO8Q9NRD0 319 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 MED17Q9NVC6 651 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CLN6Q9NWW5 311 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R16Q9NYV7 291 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 OSGIN1Q9UJX0 560 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 MMACHCQ9Y4U1 282 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 COL6A3P12111 3177 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GTQ1 180 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GWA3 101 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR2W5A6NFC9 320 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NPIPA7E9PJI5 369 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 BHLHE40O14503 412 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 AP3D1O14617 1153 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DSCR3O14972 297 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TO15178 435 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SURF4O15260 269 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MAN1A2O60476 641 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF2O60811 474 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SDC3O75056 442 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PTP4A3O75365 173 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RFPL3O75679 317 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 IGF2P01344 180 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 IGHA1P01876 353 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SCG5P05408 212 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DCNP07585 359 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NGFRP08138 427 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CCNYL3P0C7X3 344 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LIMS3P0CW19 117 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LIMS4P0CW20 117 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NPIPA8P0DM63 369 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FOLR1P15328 257 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GNSP15586 552 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CD36P16671 472 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TNNI3P19429 210 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MAOAP21397 527 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GADD45AP24522 165 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GABRA3P34903 492 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 IFNGR2P38484 337 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 AVPR1BP47901 424 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RGS6P49758 472 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 BMXP51813 675 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC37A1P57057 533 aa5.21□□□□□ -1.58
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