RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	GALNT10	Q86SR1	603 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	FJX1	Q86VR8	437 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	CMIP	Q8IY22	773 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	SAR1A	Q9NR31	198 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	MED12	Q93074	2177 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ZIC3	O60481	467 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	FCMR	O60667	390 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC22	O60826	627 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	H6PD	O95479	791 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	CPN1	P15169	458 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF17	P17021	662 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ACVR2A	P27037	513 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	CRAT	P43155	626 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	DSTN	P60981	165 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	STX5	Q13190	355 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	GPAT3	Q53EU6	434 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	EMC4	Q5J8M3	183 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	COX20	Q5RI15	118 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA21	Q7Z572	469 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	RAB8B	Q92930	207 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	TIMP4	Q99727	224 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	MED11	Q9P086	117 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	STOML1	Q9UBI4	398 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GMNC	A6NCL1	334 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SERINC4	A6NH21	518 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	EVPLL	A8MZ36	301 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241		B4DXG7	233 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJA2	O60884	412 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	UGT2B17	O75795	530 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	NR2F1	P10589	423 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	BMP7	P18075	431 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GPX2	P18283	190 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	P2RX1	P51575	399 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SMS	P52788	366 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CRISP3	P54108	245 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CASP9	P55211	416 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GPR68	Q15743	365 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CD226	Q15762	336 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GTDC1	Q4AE62	458 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	XKRX	Q6PP77	449 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ARSG	Q96EG1	525 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SFXN2	Q96NB2	322 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	VAPA	Q9P0L0	249 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	AGAP5	A6NIR3	686 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF264	O43296	627 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	HCRTR2	O43614	444 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TNFRSF21	O75509	655 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TFPT	P0C1Z6	253 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	UBL4A	P11441	157 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ETFA	P13804	333 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	HK1	P19367	917 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ADH6	P28332	368 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GNGT1	P63211	74 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF117	Q03924	483 aa		13.26	□□□□□ -0.29

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