RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 VSTM2LQ96N03 204 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GNRHR2Q96P88 292 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 BTBD9Q96Q07 612 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 LRRC37BQ96QE4 947 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 UCN2Q96RP3 112 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ADOQ96SZ5 270 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CCL19Q99731 98 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OSBPL11Q9BXB4 747 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 MYLK2Q9H1R3 596 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GALNT9Q9HCQ5 603 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SAR1AQ9NR31 198 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ATAD3AQ9NVI7 634 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 AIG1Q9NVV5 245 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ARMCX1Q9P291 453 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PACSIN3Q9UKS6 424 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SNX8Q9Y5X2 465 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 A0A087WV62 115 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PRB8 838 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PRAMEF25A6NGN4 478 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 H7C1Q1 480 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CFLARO15519 480 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SLITRK5O94991 958 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CRHP06850 196 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CT45A8P0DMV1 189 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CT45A9P0DMV2 189 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 LAMP1P11279 417 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 IDO1P14902 403 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PCSK6P29122 969 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SOAT1P35610 550 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CPOXP36551 454 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CASP3P42574 277 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SMU1Q2TAY7 513 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CT45A2Q5DJT8 189 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR2A2Q6IF42 318 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TMEM81Q6P7N7 255 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 NUP54Q7Z3B4 507 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR2L13Q8N349 312 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 NUP43Q8NFH3 380 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SLC9A6Q92581 669 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 JADE3Q92613 823 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 HGDQ93099 445 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TMCO6Q96DC7 493 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 MTERF3Q96E29 417 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 Q96MF0 132 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 COL21A1Q96P44 957 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 NODALQ96S42 347 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ZNF385DQ9H6B1 395 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 C3orf14Q9HBI5 128 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 Q9N2J8 555 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ATP6V1HQ9UI12 483 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 MAPRE3Q9UPY8 281 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PLOD2O00469 737 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 MSTNO14793 375 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TO15178 435 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TBX19O60806 448 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TMCC2O75069 709 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CBR3O75828 277 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 C6orf47O95873 294 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PRPS1L1P21108 318 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PTPN6P29350 595 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ATP4BP51164 291 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 KLF10Q13118 480 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 FGFBP1Q14512 234 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 DECR1Q16698 335 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GSTA3Q16772 222 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 EIPR1Q53HC9 387 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CHMP1BQ7LBR1 199 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GALNT10Q86SR1 603 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 IFNEQ86WN2 208 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 MIER2Q8N344 545 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 FITM2Q8N6M3 262 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 C9orf106Q8NAJ2 232 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR14L1PQ8NHC6 308 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GPR151Q8TDV0 419 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 MS4A4EQ96PG1 132 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SLC39A3Q9BRY0 314 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 MED18Q9BUE0 208 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 DUSP26Q9BV47 211 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 DPY30Q9C005 99 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ASIC5Q9NY37 505 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TESMINQ9Y4I5 508 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GPR45Q9Y5Y3 372 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CAPN7Q9Y6W3 813 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR6C70A6NIJ9 312 aa10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms