RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 GCNT6Q5T4J0 391 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 REP15Q6BDI9 236 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 OR5M10Q6IEU7 315 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 PEX5LQ8IYB4 626 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 OR8J3Q8NGG0 315 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 OR14L1PQ8NHC6 308 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 PRR7Q8TB68 274 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 RELTQ969Z4 430 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 SPATA9Q9BWV2 254 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 SLC38A1Q9H2H9 487 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 EFCAB1Q9HAE3 211 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 TAS2R10Q9NYW0 307 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 MED11Q9P086 117 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 KCNE5Q9UJ90 142 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 DKKL1Q9UK85 242 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 OSGIN2Q9Y236 505 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 AP3M1Q9Y2T2 418 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 NBASA2RRP1 2371 aa11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 C5orf58C9J3I9 102 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF264O43296 627 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 ZIC3O60481 467 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 ETS2P15036 469 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 CHMP24386 653 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 CA7P43166 264 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 P2RX1P51575 399 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 KCNJ10P78508 379 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 HSF1Q00613 529 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 RBBP4Q09028 425 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 FGFBP1Q14512 234 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 ESPL1Q14674 2120 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 MAPK11Q15759 364 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 CD226Q15762 336 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 C4orf17Q53FE4 359 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 EIPR1Q53HC9 387 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 FAM91A1Q658Y4 838 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 VASNQ6EMK4 673 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 NANOGP8Q6NSW7 305 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 AAGABQ6PD74 315 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 FGD2Q7Z6J4 655 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 SERPINA11Q86U17 422 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 IFNEQ86WN2 208 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 SLC30A8Q8IWU4 369 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 BBS10Q8TAM1 723 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 ZBTB8AQ96BR9 441 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 ARSGQ96EG1 525 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM19Q96HH6 336 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 LAT2Q9GZY6 243 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 IKZF5Q9H5V7 419 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 NANOGQ9H9S0 305 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 ICAM5Q9UMF0 924 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 SVILO95425 2214 aa11.76□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 C7orf72A4D263 438 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 B4DXG7 233 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 NPIPA2E9PIF3 369 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 NPIPA7E9PJI5 369 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 FXYD1O00168 92 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 HCRTR2O43614 444 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 DNAJA2O60884 412 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 CSTAP01040 98 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 BCHEP06276 602 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 NUDT7P0C024 238 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 NPIPA8P0DM63 369 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 ARAFP10398 606 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 UBL4AP11441 157 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 IL7RP16871 459 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 HK1P19367 917 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 SLC6A2P23975 617 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 PTGER4P35408 488 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 EIF1P41567 113 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 GFRA1P56159 465 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 CDK6Q00534 326 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF117Q03924 483 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 CBFBQ13951 182 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 ADRM1Q16186 407 aa11.75□□□□□ -0.53
HDLBP-210ENST00000423693 MAPK14Q16539 360 aa11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms