RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF681Q96N22 645 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD19PQ9H560 264 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ACOXLQ9NUZ1 547 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 EXTL2Q9UBQ6 330 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 POLHQ9Y253 713 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 DENND4AQ7Z401 1863 aa17.39■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 C12orf71A8MTZ7 269 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SMLR1H3BR10 107 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFV2P19404 249 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CLDN20P56880 219 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM44Q2T9K0 475 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 IL20RBQ6UXL0 311 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CADM2Q8N3J6 435 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 FRMD1Q8N878 549 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MCUBQ9NWR8 336 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL21Q9UJP4 597 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CDH10Q9Y6N8 788 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0G2JMP0 313 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0X1KG70 313 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 KLF4O43474 513 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ALX3O95076 343 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ERP29P30040 261 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CTHP32929 405 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ABATP80404 500 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ACSM1Q08AH1 577 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 FRRS1Q6ZNA5 592 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PEX5LQ8IYB4 626 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 KCT2Q8NC54 265 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4M2Q8NGB6 313 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNJ15Q99712 375 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 HDHD2Q9H0R4 259 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 UBQLN3Q9H347 655 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MED17Q9NVC6 651 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ASB6Q9NWX5 421 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SCN2AQ99250 2005 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRNB1P11230 501 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PAICSP22234 425 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR7G2Q8NG99 324 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GRPEL2Q8TAA5 225 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFAND1Q8TCF1 268 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 DOK4Q8TEW6 326 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 DPH1Q9BZG8 443 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GALNT9Q9HCQ5 603 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAM30Q9UKF2 790 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GPSM3Q9Y4H4 160 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GVC2 190 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 A6NIN4 97 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF13O43567 381 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GZMKP49863 264 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 AGERQ15109 404 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 NLGN3Q9NZ94 848 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PIAS3Q9Y6X2 628 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 C2CD4DB7Z1M9 353 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 H0Y8X5 98 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ARSBP15848 533 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 HTR4Q13639 388 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ASB18Q6ZVZ8 466 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4N5Q8IXE1 308 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM99Q8N816 258 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR45Q9Y484 360 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MTCH2Q9Y6C9 303 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ORC5O43913 435 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5F1O95221 314 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 HMGN1P05114 100 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ZGLP1P0C6A0 271 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXB2P14652 356 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP2CBP62714 309 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP2CAP67775 309 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TJAP1Q5JTD0 557 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNJQ5T5M9 372 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF836Q6ZNA1 936 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TRILQ7L0X0 811 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ACBD7Q8N6N7 88 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MARVELD1Q9BSK0 173 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ALG8Q9BVK2 526 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ENKD1Q9H0I2 346 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ING3Q9NXR8 418 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GSAPA4D1B5 854 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 AKR7A2O43488 359 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC19A2O60779 497 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR68Q15743 365 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL12Q53G59 568 aa17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms