RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 GPR135Q8IZ08 494 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 GALNT6Q8NCL4 622 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 FANK1Q8TC84 345 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ZFAND1Q8TCF1 268 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 RFKQ969G6 155 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 SLA2Q9H6Q3 261 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ADAP2Q9NPF8 381 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ENAMQ9NRM1 1142 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 RASD1Q9Y272 281 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 WDR45Q9Y484 360 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 MEN1O00255 615 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 KLF4O43474 513 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ALX3O95076 343 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 IGHA1P01876 353 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 HLA-DQB1P01920 261 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 AK4P27144 223 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 HLA-DMAP28067 261 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 HSD17B2P37059 387 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 GZMKP49863 264 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 DEFB134Q4QY38 66 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 FIGNL1Q6PIW4 674 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 TRILQ7L0X0 811 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 RD3Q7Z3Z2 195 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 RAB42Q8N4Z0 105 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ACTRT3Q9BYD9 372 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 CDH10Q9Y6N8 788 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 TRIOO75962 3097 aa13.1□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 SYT5O00445 386 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 GNB5O14775 395 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 CEACAM5P06731 702 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 STAT5AP42229 794 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF136P52737 540 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 GNA13Q14344 377 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 DECR1Q16698 335 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM35AQ53FP2 167 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 FAM205BPQ63HN1 556 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 MFSD12Q6NUT3 480 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 NIPAL3Q6P499 406 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 PRSS41Q7RTY9 318 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 VN1R4Q7Z5H5 301 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ARL14Q8N4G2 192 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 OR2L8Q8NGY9 312 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 OR51A7Q8NH64 312 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 GRHL3Q8TE85 626 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 PHF21AQ96BD5 680 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 TEX101Q9BY14 249 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 SLC28A3Q9HAS3 691 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 BEX1Q9HBH7 125 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ISYNA1Q9NPH2 558 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 KLHL28Q9NXS3 571 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 IRGMA1A4Y4 181 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 CENPBD1B2RD01 187 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 P2RX6O15547 441 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 LDB3O75112 727 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 NFATC1O95644 943 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 IL9P15248 144 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 PAICSP22234 425 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 FCN2Q15485 313 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 C2orf27AQ580R0 203 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 VITQ6UXI7 678 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 SSX6Q7RTT6 188 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 TCTE3Q8IZS6 198 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 OR51L1Q8NGJ5 315 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 CCL4L1Q8NHW4 92 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ORAI1Q96D31 301 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 PRSS27Q9BQR3 290 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 HDAC8Q9BY41 377 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 CERS4Q9HA82 394 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 KCNE5Q9UJ90 142 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 A0A0A6YYJ9 748 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 A0A1W2PRG6 482 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 DAPL1A0PJW8 107 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 J3QLW9 94 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 SLC31A1O15431 190 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 EFCAB14O75071 495 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 OR2B3O76000 313 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF19P17023 458 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ERVK-21P61565 698 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ADAM15Q13444 863 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 CAMK2BQ13554 666 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 ARHGEF6Q15052 776 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 CST6Q15828 149 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-204ENST00000409937 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms