RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 STACQ99469 402 aa20.2■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM109Q9BVC6 243 aa20.2■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 PIGUQ9H490 435 aa20.2■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 MED17Q9NVC6 651 aa20.2■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 GPATCH2Q9NW75 528 aa20.2■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 KLHL28Q9NXS3 571 aa20.2■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 WDR91A4D1P6 747 aa20.19■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 OIP5O43482 229 aa20.19■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 RAF1P04049 648 aa20.19■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 CD99P14209 185 aa20.19■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 RPL3P39023 403 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 SERPINB4P48594 390 aa20.19■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 CDC73Q6P1J9 531 aa20.19■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 C22orf34Q6ZV56 151 aa20.19■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 ZBTB9Q96C00 473 aa20.19■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 RNF145Q96MT1 663 aa20.19■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 DUSP22Q9NRW4 184 aa20.19■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 GIN1Q9NXP7 522 aa20.19■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 IL11P20809 199 aa20.18■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 LCN1P31025 176 aa20.18■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 TP53BP2Q13625 1128 aa20.18■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 KEAP1Q14145 624 aa20.18■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 OR10D3Q8NH80 312 aa20.18■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 ACTRT2Q8TDY3 377 aa20.18■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.18■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM185BQ9H7F4 350 aa20.18■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 CLEC4AQ9UMR7 237 aa20.18■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 PRR14LQ5THK1 2151 aa20.17■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 A0A0J9YW62 118 aa20.17■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 A0A1W2PQD3 144 aa20.17■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 DIAPH2O60879 1101 aa20.17■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 POU2F1P14859 743 aa20.17■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 DDX5P17844 614 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 PCYT1AP49585 367 aa20.17■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF117Q03924 483 aa20.17■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF844Q08AG5 666 aa20.17■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 DEFB113Q30KQ7 82 aa20.17■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 ZNF550Q7Z398 422 aa20.17■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 MREGQ8N565 214 aa20.17■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.17■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 OR5AK3PQ8NH89 298 aa20.17■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa20.17■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 ZBTB8AQ96BR9 441 aa20.17■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 EDARQ9UNE0 448 aa20.17■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 CXCL13O43927 109 aa20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 LINGO3P0C6S8 592 aa20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 PRPS1L1P21108 318 aa20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 SHC1P29353 583 aa20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 RAC1P63000 192 aa20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 HBA1P69905 142 aa20.16■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 KRT71Q3SY84 523 aa20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 FAM214BQ7L5A3 538 aa20.16■□□□□ 0.82
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KDELR3-202ENST00000409006 MISPQ8IVT2 679 aa20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 CLEC4FQ8N1N0 589 aa20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 OR56A1Q8NGH5 318 aa20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 ADAMTS15Q8TE58 950 aa20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF524Q96C55 264 aa20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 DUSP26Q9BV47 211 aa20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
KDELR3-202ENST00000409006 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.16■□□□□ 0.82
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