RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 ABCA4P78363 2273 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 A0A1W2PRB8 838 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 TTC36A6NLP5 189 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 ALG1L2C9J202 215 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 H3BQF6 201 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 KLF4O43474 513 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 NKX2-2O95096 273 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 PROCP04070 461 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 PPP3CBP16298 524 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 SLC18A2Q05940 514 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF385BQ569K4 471 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 HBMQ6B0K9 141 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 BEND4Q6ZU67 534 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 ZAR1Q86SH2 424 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 CDRT4Q8N9R6 151 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 OR4C3Q8NH37 302 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 OR2V1Q8NHB1 315 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 CLHC1Q8NHS4 586 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 MZB1Q8WU39 189 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 PPCDCQ96CD2 204 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 ADGRG7Q96K78 797 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 TSSK3Q96PN8 268 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 ACTR6Q9GZN1 396 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 LRTM1Q9HBL6 345 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 FANCFQ9NPI8 374 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 MED17Q9NVC6 651 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 DSCAMO60469 2012 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 A0A087WZY1 265 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 A0A0J9YW62 118 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 A0A1W2PNR3 127 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 SLC28A1O00337 649 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 SCDO00767 359 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 RGS14O43566 566 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 KCNK2O95069 426 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 TUBBP07437 444 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 IFI6P09912 130 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 ALOX5P09917 674 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 FAM153BP0C7A2 387 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 UROSP10746 265 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 NID1P14543 1247 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 HPGDP15428 266 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 SDC1P18827 310 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 MAP3K8P41279 467 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 NR1H2P55055 460 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 NAA20P61599 178 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 RAC1P63000 192 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 KIAA0040Q15053 153 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 DUSP5Q16690 384 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 PLPPR5Q32ZL2 321 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 FAM153CQ494X1 144 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 PDSS1Q5T2R2 415 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 CCNJQ5T5M9 372 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 SH2D5Q6ZV89 423 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 STK32CQ86UX6 486 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 IFT20Q8IY31 132 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 COX18Q8N8Q8 333 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 POC1BQ8TC44 478 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 JADE3Q92613 823 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 GIMAP5Q96F15 307 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 KLHDC3Q9BQ90 382 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 REEP4Q9H6H4 257 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 GLRX2Q9NS18 164 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 C1orf109Q9NX04 203 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 CCL27Q9Y4X3 112 aa9.24□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 VPS13CQ709C8 3753 aa9.23□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 HS3ST1O14792 307 aa9.23□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 PLIN3O60664 434 aa9.23□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 NTN1O95631 604 aa9.23□□□□□ -0.93
CLRN3-201ENST00000368671 CPA3P15088 417 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms