RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf226A1L170 272 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 HEATR9A2RTY3 570 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PRORSD1PA6NEY8 169 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ARGFXA6NJG6 315 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 K7ERI5 159 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SPINT2O43291 252 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SSX4O60224 188 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SSX5O60225 188 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 GLRA3O75311 464 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 OR2B3O76000 313 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PGLSO95336 258 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 IFNGP01579 166 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 EPOP01588 193 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RAF1P04049 648 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 KRT18P05783 430 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CALB1P05937 261 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CDK1P06493 297 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PROS1P07225 676 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SMIM6P0DI80 62 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 UMPSP11172 480 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 DARSP14868 501 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TNNI3P19429 210 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CPN2P22792 545 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 LHCGRP22888 699 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.2□□□□□ -1.92e-6■■■■□ 19.9
PTPRC-202ENST00000367364 ASMTP46597 345 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RPS9P46781 194 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 POU3F4P49335 361 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CASP4P49662 377 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 STARP49675 285 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 NUDT2P50583 147 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ATP4BP51164 291 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ARSEP51690 589 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CLCN4P51793 760 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 HSPA2P54652 639 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 AIF1P55008 147 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SLC12A3P55017 1021 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 MFAP3P55082 362 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PKNOX1P55347 436 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TAS2R40P59535 323 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 DEFA1P59665 94 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 DEFA3P59666 94 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PSME3P61289 254 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ACY1Q03154 408 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 LGALS3BPQ08380 585 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RAPSNQ13702 412 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ALCAMQ13740 583 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 IRF3Q14653 427 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 VEPH1Q14D04 833 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TAB1Q15750 504 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CARTPTQ16568 116 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RNF212Q495C1 297 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 BCL7AQ4VC05 210 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf220Q5T0J3 134 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 MPP7Q5T2T1 576 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD22Q5VYY1 191 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 KRT79Q5XKE5 535 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SLC27A4Q6P1M0 643 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TEX261Q6UWH6 196 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 Q6ZVH6 145 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PIGZQ86VD9 579 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CATSPER3Q86XQ3 398 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RIMKLAQ8IXN7 391 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CRYBG2Q8N1P7 616 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 NKAIN3Q8N8D7 197 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PSMA8Q8TAA3 256 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 BIRC7Q96CA5 298 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RCN3Q96D15 328 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 HYLS1Q96M11 299 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RNF145Q96MT1 663 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RILPQ96NA2 401 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RIT2Q99578 217 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RAD9AQ99638 391 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TTYH2Q9BSA4 534 aa3.2□□□□□ -1.9
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