RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ATG12O94817 140 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CHMP24386 653 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINA12Q8IW75 414 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 KDM1BQ8NB78 822 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 SYT3Q9BQG1 590 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CD93Q9NPY3 652 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 SNAPC5O75971 98 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 HTR2AP28223 471 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 TNFRSF4P43489 277 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 OR1D4P47884 311 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 PRSS48Q7RTY5 328 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 OR9A4Q8NGU2 314 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 AP1S3Q96PC3 154 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 DCBLD2Q96PD2 775 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 HAO2Q9NYQ3 351 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ACTBP60709 375 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ACTG1P63261 375 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 GPR50Q13585 617 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 PLCXD3Q63HM9 321 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 TAAR2Q9P1P5 351 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJB5O75953 348 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CTSL3PQ5NE16 218 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CBLCQ9ULV8 474 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 H7C2Y5 167 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf105O95561 183 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ERVK-16P61578 105 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 MS4A2Q01362 244 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 OR4D6Q8NGJ1 314 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO27Q8NI29 283 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 OR7D2Q96RA2 312 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 SSX3Q99909 188 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 SLC6A16Q9GZN6 736 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0G2JNG1 304 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 TTLL8A6PVC2 850 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 KIR2DS3K7RE56 304 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ABOP16442 354 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 KIR2DS5Q14953 304 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC18Q8N456 261 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTS4O75173 837 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 IVDP26440 423 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ADAM12O43184 909 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 C1SP09871 688 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CAV2P51636 162 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 TDGQ13569 410 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 PGM2L1Q6PCE3 622 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 IL20RBQ6UXL0 311 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 MYADMQ96S97 322 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL13Q9P2N7 655 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHB10Q9UN67 800 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CD38P28907 300 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 WNT4P56705 351 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF610Q8N9Z0 462 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ULBP3Q9BZM4 244 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ENKD1Q9H0I2 346 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 THSD1Q9NS62 852 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 MYH8P13535 1937 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CER1O95813 267 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 GLO1Q04760 184 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CPXM2Q8N436 756 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CHRDQ9H2X0 955 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 KIF18BQ86Y91 864 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 INIPQ9NRY2 104 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 IDUAP35475 653 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 OR1S1Q8NH92 325 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 PHB2Q99623 299 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 OR10A5Q9H207 317 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 OR10A2Q9H208 303 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF696Q9H7X3 374 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 HIDE1A8MVS5 230 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 EDN3P14138 238 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 KRBOX4Q5JUW0 171 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 SYNPRQ8TBG9 265 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 DUSP23Q9BVJ7 150 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 DENRO43583 198 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 CHRM4P08173 479 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 RGRP47804 291 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 ENTPD8Q5MY95 495 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 IL1F10Q8WWZ1 152 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 DCUN1D4Q92564 292 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms