RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 FAM181AQ8N9Y4 354 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 OR8D2Q9GZM6 311 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 LRRN3Q9H3W5 708 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A19Q9HC21 320 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTB-201ENST00000331789 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa16.52■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PPW3 197 aa16.52■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 NPIPB9F8W1W9 429 aa16.52■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 KLF4O43474 513 aa16.52■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 FMO6PO60774 539 aa16.52■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ADAM11O75078 769 aa16.52■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa16.52■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa16.52■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 G6PC3Q9BUM1 346 aa16.52■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SLC24A3Q9HC58 644 aa16.52■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 FPR3P25089 353 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 STAT5AP42229 794 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 PCYT1AP49585 367 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ATP12AP54707 1039 aa16.51■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 OR4C3Q8NH37 302 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 TEX47Q8TBZ9 253 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ZNF721Q8TF20 911 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ZFAND2BQ8WV99 257 aa16.51■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF559Q9BR84 538 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SLC22A11Q9NSA0 550 aa16.51■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa16.51■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 TRIM64BA6NI03 449 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 TTC36A6NLP5 189 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD34CP0C6C1 535 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SMSP52788 366 aa16.51■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 NSDHLQ15738 373 aa16.51■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 UBE2UQ5VVX9 321 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16.51■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa16.51■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 PFN4Q8NHR9 129 aa16.51■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 RAB2BQ8WUD1 216 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CCDC74BQ96LY2 380 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 OR6C1Q96RD1 312 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 NUDT9Q9BW91 350 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CTSFQ9UBX1 484 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ENPP5Q9UJA9 477 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 MKL2Q9ULH7 1088 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 EFCAB10A6NFE3 127 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CDC42EP2O14613 210 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 YKT6O15498 198 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 TIAF1O95411 115 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CCNA2P20248 432 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SLC15A1P46059 708 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 LPAL2Q16609 132 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 TRIM61Q5EBN2 209 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.5■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 SLC38A9Q8NBW4 561 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 TMEM239Q8WW34 195 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 Q96MT0 163 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 VN1R1Q9GZP7 353 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 TAS2R16Q9NYV7 291 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 VCANP13611 3396 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 TMEM221A6NGB7 291 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 M0R296 226 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 IGKV3-11P04433 115 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 FUT1P19526 365 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 MAKP20794 623 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 RORAP35398 523 aa16.49■□□□□ 0.23
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