RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 IL3P08700 152 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 DUX4L4P0CJ87 422 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 SPP1P10451 314 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 NR2F1P10589 423 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 PTHLHP12272 177 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 IFNGR1P15260 489 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 ATF1P18846 271 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 UQCRC2P22695 453 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 B4GALNT1Q00973 533 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 CNTN1Q12860 1018 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 HFEQ30201 348 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 LRRC73Q5JTD7 316 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 C1orf94Q6P1W5 598 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 RPTNQ6XPR3 784 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 TMEM17Q86X19 198 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 CPOQ8IVL8 374 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 ABHD4Q8TB40 342 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 HIST1H2ACQ93077 130 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 TTTY10Q9BZA0 68 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 MFFQ9GZY8 342 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 BRD9Q9H8M2 597 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 BRF2Q9HAW0 419 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 NIT2Q9NQR4 276 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 DUX4Q9UBX2 424 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 A0A1B0GUH1 482 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 C17orf102A2RUQ5 167 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 OR6C65A6NJZ3 312 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 OR2AG2A6NM03 316 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 FAM25EA8MYX2 175 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 J3QLW9 94 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 FRS3O43559 492 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 PRAMEF2O60811 474 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 NFATC1O95644 943 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 F2P00734 622 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 RLN1P04808 185 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF19P17023 458 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 GSTM3P21266 225 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 MST1P26927 711 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 PSEN2P49810 448 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 GMFBP60983 142 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 DYRK1AQ13627 763 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 MED27Q6P2C8 311 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 C6orf120Q7Z4R8 191 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 SLC9B2Q86UD5 537 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 NAXDQ8IW45 347 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 CMIPQ8IY22 773 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 CPXM2Q8N436 756 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 OR1M1Q8NGA1 313 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 OR5D16Q8NGK9 328 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 OR52N1Q8NH53 320 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 OR52I2Q8NH67 350 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 KAT2AQ92830 837 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 NEIL2Q969S2 332 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 SUSD3Q96L08 255 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 PDCD10Q9BUL8 212 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 TEX12Q9BXU0 123 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 MED20Q9H944 212 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 LHX3Q9UBR4 397 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 DENND4AQ7Z401 1863 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 A0A087WUU8 490 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 PQLC2LA1A4F0 135 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 GFYI3L273 518 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 UGDHO60701 494 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 SLC16A8O95907 504 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 IGLV3-27P01718 113 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 GAAP10253 952 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF35P13682 527 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms